Earticle

현재 위치 Home 검색결과

결과 내 검색

발행연도

-

학문분야

자료유형

간행물

검색결과

검색조건
검색결과 : 25
No
1

터널 설계 및 시공 지반정보의 분석을 위한3차원 가시화 소프트웨어 개발

김성중, 최요순, 박형동, 배규진

[NRF 연계] 한국자원공학회 한국자원공학회지 Vol.45 No.1 2008.02 pp.42-53

※ 협약을 통해 무료로 제공되는 자료로, 원문이용 방식은 연계기관의 정책을 따르고 있습니다.

원문보기

In this study, new software for 3D visualization of geological data was developed for a tunneling industry. The software can visualize various types of geological data such as borehole, electric resistivity, seismic velocity, estimated 3D RMR, face mapping, etc. which can be obtained from design to construction stages in a tunneling project. By using the OpenGL (Open Graphics Library) and optimized spatial data structures (e.g., Octree), the performance of 3D visualization could be improved significantly. The developed software was successfully applied to a recent tunneling site. This paper describes the concept and details of the software development and implementation.

2

4,600원

소프트웨어 산업은 아직도 뿌리깊은 문제에 시달리고 있다. 어떻게 보면, 제조업과 같은 보다 성숙한 산업의 모범사례로부터 뭔가를 배워야 할 지 모른다. 제조업에서의 ‘린’ 원칙을 소프트웨어 개발에 적용하는 것도 한방안일 수 있다. 소프트웨어공학 문헌에서 이런 ‘린’ 원칙은 시도해 볼만한 것으로 언급되었다. 그러나 이들 원칙을 실제 어떻게 적용할 수 있을 가에 대한 구체적 방안을 제시한 연구는 별로 없었다. 본 연구는 ‘린’ 원칙을 소프트웨어 개발에 적용하는 방안을 제시하고자 한다. 이 방안의 핵심은 낭비제거라는 린의 관점을 구체화하기 위하여 프로젝트에서의 리드 타임과 결함을 누적 흐름도(Cumulative Flow Diagram)을 통해 관리하는 방법이다. 또한 이 방안을 실제 프로 젝트 사례에 적용함 으로써 타당성을 검증하고 적용 방법에 대한 이해를 돕고자 하였다.

Software industry still has many deep-seated problems. As a natural consequence, it may have to learn from best practices in more mature industry like manufacturing. An example is ‘lean’ software development which is defined as translation of ‘lean manufacturing’ principles to the software development domain. The principles include ‘eliminate waste’ and ‘amplify learning.’ It was much asserted that these principles are worth applying. Not much study, however, was done on how to practically implement these principles into software development practice. In this study we attempt to present a method in which project lead time and software defects are regarded as major targets of management and are visualized using Cumulative Flow Diagram. We further applied this method on actual projects. The result confirms that agile is positively effective on reducing wastes.

3

Management Program for Specimen Information Database (MPSID) is using by Korean Herbarium of Standard Herbal Resources at Korea Institute of Oriental Medicine. This software was coded in PHP language, it provides user-friendly web interface, and it shows information of specimen collecting location visually using SVG (Scalable Vector Graphics) format map data. This system is different to general GIS (Geographic Information System), but it is helpful to get the collecting locations for user. In this article, visualization method of MPSID for collecting locations was introduced.

4

소프트웨어 유지보수 지원을 위한 기술 부채 자동 탐지 및 시각화 시스템 개발 KCI 등재후보

오영규, 김재웅

중소기업융합학회 산업과 과학 제4권 제5호 2025.09 pp.58-64

※ 기관로그인 시 무료 이용이 가능합니다.

4,000원

소프트웨어 개발과정에서 발생하는 기술 부채는 유지보수 비용을 증가시키고 시스템 품질 저하를 초래할 수 있다. 본 연구에서는 중복 코드, 과도하게 긴 메서드 등 주요 유형의 기술 부채를 자동으로 탐지하고 시각화하는 시스템을 설계하였다. 이를 위해 PMD, Checkstyle, SonarQube 등 정적 분석 도구를 활용하여 코드 내 부채 요소를 분석하고, 그 결과를 대시보드 형태로 시각화하였다. 대시보드는 부채의 유형, 발생 위치, 시간에 따른 변화 추이를 직관적으로 제공함으로써 개발자와 관리자가 기술 부채를 효율적으로 파악할 수 있도록 구성되었다. 실제 오픈소스 프로젝트에 본 시스템을 적용한 결과, 기술 부채 현황을 명확하게 식별할 수 있었으며, 유지보수 전략 수립 및 실행에 실질적인 도움이 됨을 확인하였다.

Technical debt incurred during software development can lead to increased maintenance costs and decreased software quality. This study proposes a system that automatically detects and visualizes key types of technical debt, such as code duplication and excessively long methods. By leveraging static analysis tools including PMD, Checkstyle, and SonarQube, the system analyzes source code and presents the detected debt in a dashboard format. The dashboard enables intuitive understanding of the types, locations, and trends of technical debt over time. When applied to real open-source projects, the system proved effective in providing a clear overview of technical debt status and supporting the planning and execution of maintenance activities.

5

Automatic UML Design Extraction with Software Visualization based on Reverse Engineering KCI 등재

Se Jun Jung, Janghwan Kim, Won Young Lee, Bo Kyung Park, Hyun Seung Son, R. Young Chul Kim

국제인공지능학회(구 한국인터넷방송통신학회) The International Journal of Advanced Smart Convergence Volume 10 Number 3 2021.09 pp.89-96

※ 원문제공기관과의 협약기간이 종료되어 열람이 제한될 수 있습니다.

In various areas of the 4th industry, a big issue is software quality enhancement for stability and reliability of the smart software systems. After revising software promotion law at 2020, we must clearly define requirements and separate design parts and implementation parts of an all public software development contracts. In this study, we need to validate whether the final implementation of software is followed by the original design or not. To do this, we consider the design restoration through software visualization based on reverse engineering. Therefore we propose an UML design extraction and visualization method based on reverse engineering. Based on this, we may validate whether it is implemented according to the original design, and how much visualizes and includes the code the internal complexity for improvement of software quality.

6

A Visualization Approach for Bug Reports in Software Systems SCOPUS

Maen Hammad, Somia Abufakher, Mustafa Hammad

보안공학연구지원센터(IJSEIA) International Journal of Software Engineering and Its Applications Vol.8 No.10 2014.10 pp.37-46

※ 원문제공기관과의 협약기간이 종료되어 열람이 제한될 수 있습니다.

For widely-used and large software systems, there is huge number of daily submitted bug reports. These bug reports are mainly submitted by different developers with different roles during software development process. Therefore, understanding and monitoring the status of all submitted bug reports is not an easy task. Each bug report has various and different statuses over time. Furthermore, the relationship between bug reports and developers is complicated and hard to detect. In this paper, we propose a solution to help software project managers or bug trackers to understand the current and the previous statuses of large number of submitted bug reports. We propose a visualization approach to model the different statuses of bug reports and their relationships with developers who work on them. The visualization is based on extracting information from bug tracking systems and modeling them in comprehensive and meaningful views.

7

Study on Application Case of Scrum Methodology using Visibility KCI 등재

Eun-Sun Chang, Neung-Hoe Kim

국제인공지능학회(구 한국인터넷방송통신학회) The International Journal of Advanced Smart Convergence Volume 8 Number 3 2019.09 pp.161-166

※ 원문제공기관과의 협약기간이 종료되어 열람이 제한될 수 있습니다.

Viewed in the rate of change in the web environment, it is very difficult to remain the initial planning at the time until the time of launch, and there is a need for a method to accommodate changes and satisfy market demands during the development process. Unlike the traditional waterfall approach of maintaining initial planning, scrum is one of the agile methodologies that enables flexibility to respond to changes in the market and customers' needs and drive customer satisfaction and business success. However, to apply the scrum to a project in actual, the practice method itself is relatively simple but not easy to apply. The reason is that the members of the organization need to understand and participate in scrum's philosophy and principles and the continuous observation and change management should be carried out. Therefore, in this paper, we presented the feature dashboard and customized scrum methodology to enable continuous observation and change management using visibility, and we shared the case that periodically reflected inspection and adaptation with the explanation of the main points. Also, based on the experience with participants, the strengths and weakness of the feature dashboard and the customized scrum methodology are summarized.

8

Visualizing and Analyzing the Structure of AspectJ Software under the Eclipse Platform SCOPUS

Sassi Bentrad, Djamel Meslati

보안공학연구지원센터(IJSEIA) International Journal of Software Engineering and Its Applications Vol.7 No.3 2013.05 pp.353-376

※ 원문제공기관과의 협약기간이 종료되어 열람이 제한될 수 있습니다.

Software is naturally intangible and abstract which makes the understanding task difficult. There is a growing need for visualizations that improve the comprehensiveness of its structure, behavior and evolution. Graphically visualizing abstract concepts provides a way to raise the abstraction level and therefore, to reduce the software complexity. The graphical visualization has an important contribution by presenting the software under an abstract synthetic view that gives a quick idea of its content, logic, structure and its entities' relationships. It is widely accepted that it can represent a valuable support during the development and maintenance processes. As AspectJ is a relatively new language with powerful specific constructs, it deserves support tools to visualize its software systems. This paper presents our recent work in software visualization with respect to analyze and visualize the AspectJ software structures using graphical elements well-known from daily life such as the Polymetric View and the City Metaphor to conduct various powerful analyses and permit an intuitive understanding of a given visualization and therefore, to get quickly an overview of a huge and complex software. VizzAspectJ-2D and VizzAspectJ-3D are two tools support we have built on top of the Eclipse platform respectively for the 2D and 3D visualizations.

9

CGHscape: A Software Framework for the Detection and Visualization of Copy Number Alterations

Jeong, Yong-Bok, Kim, Tae-Min, Chung, Yeun-Jun

[Kisti 연계] 한국유전체학회 Genomics & informatics Vol.6 No.3 2008 pp.126-129

※ 협약을 통해 무료로 제공되는 자료로, 원문이용 방식은 연계기관의 정책을 따르고 있습니다.

원문보기

The robust identification and comprehensive profiling of copy number alterations (CNAs) is highly challenging. The amount of data obtained from high-throughput technologies such as array-based comparative genomic hybridization is often too large and it is required to develop a comprehensive and versatile tool for the detection and visualization of CNAs in a genome-wide scale. With this respective, we introduce a software framework, CGHscape that was originally developed to explore the CNAs for the study of copy number variation (CNV) or tumor biology. As a standalone program, CGHscape can be easily installed and run in Microsoft Windows platform. With a user-friendly interface, CGHscape provides a method for data smoothing to cope with the intrinsic noise of array data and CNA detection based on SW-ARRAY algorithm. The analysis results can be demonstrated as log2 plots for individual chromosomes or genomic distribution of identified CNAs. With extended applicability, CGHscape can be used for the initial screening and visualization of CNAs facilitating the cataloguing and characterizing chromosomal alterations of a cohort of samples.

10

나쁜 코딩 습관 개선을 위한 코드 가시화 연구

박지훈, 김영철

[Kisti 연계] 한국정보처리학회 한국정보처리학회 학술대회논문집 2016 pp.477-480

※ 협약을 통해 무료로 제공되는 자료로, 원문이용 방식은 연계기관의 정책을 따르고 있습니다.

원문보기

최근 소프트웨어 시장의 규모와 위상은 급속도로 성장하고 있다. 하지만 커지는 산업에 비해서 소프트웨어의 품질에 대한 인식은 아직 미흡하다. 국내 중소기업의 경우 인력, 비용 등의 여러 측면에서 어려움이 존재한다. 구현 중심의 개발이 이루어지면서 소프트웨어의 품질보다 빠른 개발에 초점을 두어 저 품질의 소프트웨어를 양산하고 있다. 본 논문에서는 이를 해결하기 위한 가시화를 통해 나쁜 코딩 습관을 개선하여 소프트웨어의 품질향상을 도모한다. 가시화를 통해 소스 코드에서 개선되어야 할 부분을 찾아내 소프트웨어의 품질을 향상시킬 수 있을 것으로 기대한다.

11

나쁜 코딩 습관 개선을 위한 코드 가시화 연구

박지훈, 김영철

[Kisti 연계] 한국정보처리학회 한국정보처리학회 학술대회논문집 2016 pp.477-480

※ 협약을 통해 무료로 제공되는 자료로, 원문이용 방식은 연계기관의 정책을 따르고 있습니다.

원문보기

최근 소프트웨어 시장의 규모와 위상은 급속도로 성장하고 있다. 하지만 커지는 산업에 비해서 소프트웨어의 품질에 대한 인식은 아직 미흡하다. 국내 중소기업의 경우 인력, 비용 등의 여러 측면에서 어려움이 존재한다. 구현 중심의 개발이 이루어지면서 소프트웨어의 품질보다 빠른 개발에 초점을 두어 저 품질의 소프트웨어를 양산하고 있다. 본 논문에서는 이를 해결하기 위한 가시화를 통해 나쁜 코딩 습관을 개선하여 소프트웨어의 품질향상을 도모한다. 가시화를 통해 소스 코드에서 개선되어야 할 부분을 찾아내 소프트웨어의 품질을 향상시킬 수 있을 것으로 기대한다.

12

뇌 MR영상 수동분할을 위한 VTK기반의 3차원 가시화 소프트웨어 툴 설계

윤호성, 문치웅, 김영훈, 최흥국

[Kisti 연계] 한국멀티미디어학회 멀티미디어학회논문지 Vol.18 No.2 2015 pp.120-127

※ 협약을 통해 무료로 제공되는 자료로, 원문이용 방식은 연계기관의 정책을 따르고 있습니다.

원문보기

Mild Cognitive Impairment(MCI) is a prior step to Alzheimer's Disease(AD). It is different from AD which is seriously affecting daily life. Particularly, the hippocampus could be charged a crucial function for forming memory. MCI has a high risk about progress to AD. Our investigated research for a relationship between hippocampus and AD has been studied. The measurement of hippocampus volumetric is one of the most commonly used method. The three dimensional reconstructed medical images could be passible to interpret and its examination in various aspects but the cost of brain research with the medical equipment is very high. In this study, 3D visualization was performed from a series of brain Magnetic Resonance Images(MRI) and we have designed and implemented a competitive software tool based on the open libraries of Visualization ToolKit(VTK). Consequently, our visualization software tool could be useful to various medical fields and specially prognosis and diagnosis for MCI patients.

13

개선된 GUI기반의 전력조류분석용 소프트웨어개발에 관한 연구

이희영

[Kisti 연계] 한국컴퓨터산업교육학회 한국컴퓨터산업교육학회 논문지 Vol.4 No.10 2003 pp.611-620

※ 협약을 통해 무료로 제공되는 자료로, 원문이용 방식은 연계기관의 정책을 따르고 있습니다.

원문보기

본 논문에서는 상정사고를 감안한 개선된 GUI기반의 전력계통의 조류해석 도구를 제시하였다. 제시한 툴은 전력계통의 조류계산의 교수 및 학습을 돕는 효과적인 도구이다. 이 소프트웨어는 Asymetrix사의 ToolBookII로 개발하였으며 명칭을 PFGUI(Power Flow GUI)로 정하였다. PFGUI는 입력매개변수와 그 결과간의 관계성을 테이블 형태가 아닌 시각적인 그림으로 보여 주기 때문에 전력계통운용및 제어의 연구에 더욱 친화적이다 PFGUI는 선로탈락시의 조류계산 출력을 계통구성도상에 같이 나타내도록 하였다. 사용자들은 계동도강에서 조류계산의 시스템 데이터를 입력하고 손쉽게 모선의 전압과 전력, 선로조류에 대한 결과도를 확인 할 수 있다. 또한 선로전압조정기, 콘덴서, 부하레벨, 선로탈락 등의 다양한 형태의 영향을 파악할 수 있다. 제안된 PFGUI는 Ward-Hale 6-Bus 계통을 연구대상으로 하였다.

This paper presents improved GUI based analysis tool o( load flow of power system (or contingency. It is effective tool to facilitate the teaching and learning of load flow of power system. This software is the named of PFGUI(Power Flow GUI) that written in TooIBookII of Asymetrix. The PFGUI is friendly for study for power system operation and control because picture provide a better visualizing of relationships between input parameters and effects than a tabula type result. This PFGUI enables topology and the output data of load flow for line outages to be shown on same picture page. Users can input the system data for power flow on the the picture and can easily see the the result diagram of bus voltage, bus power, line flow. It is also observe the effects of different types of variation of tap, shunt capacitor, loads level, line outages. Proposed PFGUI has been studied on the Ward-Hale 6-Bus system.

14

소프트웨어 가시화를 통한 품질 개선 사례 연구

박보경, 권하은, 손현승, 김영수, 이상은, 김영철

[Kisti 연계] 한국정보과학회 정보과학회논문지 Vol.41 No.11 2014 pp.935-942

※ 협약을 통해 무료로 제공되는 자료로, 원문이용 방식은 연계기관의 정책을 따르고 있습니다.

원문보기

오늘날 소프트웨어는 규모가 크고 시장 출하 기간의 단축 상황에서도 고품질 이슈가 중요하다. 그리고 산업 현장에서는 빠른 개발을 위해 아직도 코드 중심 개발에 초점을 두고 있다. 따라서 1) 개발자의 나쁜 코드 개발 습관의 개선 측면 그리고 2) 소프트웨어 비설계화, 비문서화 및 코드 내부 구조 비가시화의 유지보수 측면 등을 해결해야 한다. 이에 코드 가시화의 필요성이 대두되고 있다. 본 논문에서는 객체지향 코드의 내부 구조 시각화 방법을 위해 Tool-Chain을 이용한 내부 구조 가시화 방법과 품질 개선 절차를 제안한다. 사례로써 NIPA의 SW Visualization 기법을 실제 객체 코드에 적용한다. 먼저 객체지향 코드의 모듈 단위를 클래스로 정의하고, 코드의 정량적 분석 및 가시화를 통해 코드의 복잡도(Code Complexity)를 줄이고자 하였다.

Today, it is very important issue to high quality of software issue on huge scale of code and time-to-market. In the industrial fields still developers focuses on Code based development. Therefore we try to consider two points of views 1) improving the general developer the bad development habit, and 2) maintenance without design, documentation and code visualization. To solve these problems, we need to make the code visualization of code. In this paper, we suggest how to visualize the inner structure of code, and also how to proceed improvement of quality with constructing the Tool-Chain for visualizing Java code's inner structure. For our practical case, we applied Object Code with NIPA's SW Visualization, and then reduced code complexity through quantitatively analyzing and visualizing code based on setting the basic module unit, the class of object oriented code.

15

PC 기반의 3차원 탄성파 자료 시각화 소프트웨어 개발 연구

김현규, 이두성

[Kisti 연계] 한국지구물리·물리탐사학회 지구물리와 물리탐사 Vol.6 No.1 2003 pp.35-39

※ 협약을 통해 무료로 제공되는 자료로, 원문이용 방식은 연계기관의 정책을 따르고 있습니다.

원문보기

OpenGL을 이용하여 PC환경에서 3차원 탄성파 자료를 쉽게 시각화하고 분석할 수 있는 소프트웨어를 개발하였다. 기본적인 시각화 기능으로서 3차원 자료를 볼륨과 단면으로 도시할 수 있게 하였으며, 자료의 색 분포를 쉽게 결정할 수 있는 인터페이스를 제작하였다. 색은 RGB나 HSV형식으로 표현할 수 있게 하였으며 투명도를 지정할 수 있으므로 여러 자료를 중첩하여 도시하는 것이 가능하다. 자료 분석 기능의 하나로서 유도 피킹 방법을 이용하여 층준을 발췌할 수 있으며, 발췌된 층준은 점, 망, 면 등으로 도시하여 3차원적으로 분석할 수 있다.

A software to visualize and analyse 3-D seismic data is developed using OpenGL, one of the most popular 3-D graphic library, under the PC and Windows platform. The software can visualize the data as volume and slices, whose color distribution is specified by a special dialog box that can pick a color in RGB or HSV format. The dialog box can also designate opacity values so that several 3-D objects can be displayed superimposed each other. Horizon picking is implemented very easily with this software thanks to the guided picking method. The picked points from a horizon will compose a set of points, mesh, and a surface, which can be viewed and analysed in three dimensions.

16

요구사항 추적성을 위한 소프트웨어 프로세스 가시화 구축 자동화

이진협, 손현승, 박지훈, 장우성, 김영철

[Kisti 연계] 한국정보처리학회 한국정보처리학회 학술대회논문집 2017 pp.639-641

※ 협약을 통해 무료로 제공되는 자료로, 원문이용 방식은 연계기관의 정책을 따르고 있습니다.

원문보기

소프트웨어 대형화로 소프트웨어 복잡도가 높아져 고품질화가 이슈이다. 또한 프로젝트를 위한 개발 및 관리도 고품질화에 중요한 부분이다. 이런 효율적 프로젝트 관리 구축은 쉽게 프로젝트 이슈, 구성원, 일정, 산출물, 보고 등등 관리가 용이하여 고품질화에 도움을 줄 수 있다. 문제는 구축이 어렵고 이를 통한 내재화가 필수적이다. 이 논문에서는 자동화 프로세스 가시화 구축 방안과 이를 통한 요구사항 추적성 확보를 제안한다. 이를 위해, 기존 오픈 소스들의 '체인(chain) 및 연결 정보'의 자동화 방안으로 고품질의 소프트웨어를 구축하고자 한다.

17

요구사항 추적성을 위한 소프트웨어 프로세스 가시화 구축 자동화

이진협, 손현승, 박지훈, 장우성, 김영철

[Kisti 연계] 한국정보처리학회 한국정보처리학회 학술대회논문집 2017 pp.639-641

※ 협약을 통해 무료로 제공되는 자료로, 원문이용 방식은 연계기관의 정책을 따르고 있습니다.

원문보기

소프트웨어 대형화로 소프트웨어 복잡도가 높아져 고품질화가 이슈이다. 또한 프로젝트를 위한 개발 및 관리도 고품질화에 중요한 부분이다. 이런 효율적 프로젝트 관리 구축은 쉽게 프로젝트 이슈, 구성원, 일정, 산출물, 보고 등등 관리가 용이하여 고품질화에 도움을 줄 수 있다. 문제는 구축이 어렵고 이를 통한 내재화가 필수적이다. 이 논문에서는 자동화 프로세스 가시화 구축 방안과 이를 통한 요구사항 추적성 확보를 제안한다. 이를 위해, 기존 오픈 소스들의 '체인(chain) 및 연결 정보'의 자동화 방안으로 고품질의 소프트웨어를 구축하고자 한다.

18

뇌종양 및 그 주변 신경다발의 통합적 가시화를 위한 소프트웨어의 개발

오정수, 조익환, 나동규, 장기현, 박광석, 송인찬

[Kisti 연계] 대한자기공명의과학회 대한자기공명의과학회지 Vol.9 No.1 2005 pp.2-8

※ 협약을 통해 무료로 제공되는 자료로, 원문이용 방식은 연계기관의 정책을 따르고 있습니다.

원문보기

목적 : 뇌종양 및 확산텐서 영상으로 얻어진 그 주변 신경 다발을 동시에 가시화하는 소프트웨어를 구현하고 그것을 통해 뇌종양이 그 주변 신경다발에 미치는 영향에 대한 조사에의 적용 가능성을 시험해 보고자하였다. 대상 및 방법 : IDL을 기반으로 뇌종양과 그 주변 신경다발의 통합적 가시화를 구현하였다. 뇌종양을 가진 한 환자에 대한 T1 강조영상 및 확산텐서 영상을 포함하는 자기공명영상이 3.0T자기공명장치에서 획득되었다. 우리는 해부학적 정보를 위해 두개골을 제거한 뇌 영상과 구획화된 뇌종양을 위한 대조강화 T1 강조 영상을 이용하여 서피스 및 볼륨렌더링을 사용하였다. 대뇌 백질 신경 다발추적을 위해 사용되는 확산텐서영상을 위해서는 25개 방향의 확산경사 자계를 이용하는 SE-EPI방법을 사용하였다. 신경 다발추적 방법으로는 streamline과 tensorline 방법을 사용하였다. T1 강조 영상 및 확산텐서 영상의 공간적 불일치를 보정하기 위해 SPM을 이용한 정합을 수행하였다. 우리의 소프트웨어는 PC 윈도우 환경에서 작동할 수 있도록 구현되었다. 결과 : 한 명의 뇌종양 환자에 대하여 튜브 모양의 신경다발, 대뇌 백질 서피스 렌더링 , 뇌종양의 볼륨/서피스렌더링의 통합적 가시화를 성공적으로 구현하였다. 결론 : 우리의 결과는 뇌종양 및 그 주변 신경다발의 통합적 가시화의 실현 가능성을 보여주었다. 더불어 우리의 구현된 통합적 가시화는 뇌종양 부위 및 그 주변 부의의 대뇌 백질 확산 비등방성의 정량적인 분석에 사용될 수 있을 것으로 기대된다.

Purpose : The purpose of this study was to implement a software to visualize tumor and its surrounding fiber tracts simultaneously using diffusion tensor imaging and examine the feasibility of our software for investigating the influence of tumor on its surrounding fiber connectivity. Material and Methods : MR examination including T1-weigted and diffusion tensor images of a patient with brain tumor was performed on a 3.0 T MRI unit. We used the skull-striped brain and segmented tumor images for volume/surface rendering and anatomical information from contrast-enhanced T1-weighted images. Diffusion tensor images for the white matter fiber-tractography were acquired using a SE-EPI with a diffusion scheme of 25 directions. Fiber-tractography was performed using the streamline and tensorline methods. To correct a spatial mismatch between T1-weighted and diffusion tensor images, they were coregistered using a SPM. Our software was implemented under window-based PC system. Results : We successfully implemented the integrated visualization of the fiber tracts with tube-like surfaces, cortical surface and the tumor with volume/surface renderings in a patient with brain tumor. Conclusion : Our result showed the feasibility of the integrated visualization of brain tumor and its surrounding fiber tracts. In addition, our implementation for integrated visualization can be utilized to navigate the brain for the quantitative analysis of fractional anisotropy to assess changes in the white matter tract integrity of edematic and peri-edematic regions in a number of tumor patients.

19

전 유전체 단계적 가시화를 위한 새로운 컴포넌트 소프트웨어

정우근, 조치영, 조환규

[Kisti 연계] 한국정보처리학회 한국정보처리학회 학술대회논문집 2009 pp.988-991

※ 협약을 통해 무료로 제공되는 자료로, 원문이용 방식은 연계기관의 정책을 따르고 있습니다.

원문보기

게놈 데이터의 지속적인 증가로 인해 생물정보학에서 유전체 정보를 체계적으로 저장하고 열람하는 효과적이고 효율적인 시스템을 확립하는 것은 중요한 일이다. 잘 알려진 게놈 정보의 계층적 구조처럼 우리는 게놈의 내부 구조를 연구하기 위한 우수한 툴도 필요하다. 게놈 연구에 있어서 한 가지 문제는 유전체 정보는 너무 거대해서 표준적인 정보 처리를 이용하는 간단한 툴로는 작업하기 어려운 점이다. 예를 들어 특정 게놈 데이터 크기는 100메가 바이트를 넘는다. 추가적으로 유전자, promoters, retro-elements(HERV), operons, exon-introns와 같은 많은 게놈 요소들이 있다. 전통적으로 생물학자 들은 게놈 연구를 위해 툴을 아무거나 사용하지 않고, 보통 그들의 연구에 좋은 툴을 채택하려 노력했다. 게놈 연구에서 기본적이고 주시할만한 단계는 다른 종과 유전체 요소를 비교하기 위해 위치를 인식할 수 있도록 하나의 화면에 모든 게놈 데이터를 시각화하는 것이다. 생물학자에게 툴의 개발은 많은 시간이 걸리고 시행착오를 겪기 쉬운 일이다. 이 논문에서 우리는 전체 게놈 중 어떤 게놈 요소를 시각화하는 컴포넌트 웨어의 셋을 제안한다. 그리하여 실험을 목적으로 생물학자를 만나서 우리의 셋을 이용하여 컴포넌트를 조합하여 소프트웨어를 만드는 것은 비교적 간단한 작업이다. 이 실험에서 우리는 HERV와 연동되는 게놈 요소를 보여주는 툴을 어떻게 우리의 컴포넌트 웨어를 간단히 조합하여 구축하는지를 보여주겠다.

20

전 유전체 단계적 가시화를 위한 새로운 컴포넌트 소프트웨어

정우근, 조치영, 조환규

[Kisti 연계] 한국정보처리학회 한국정보처리학회 학술대회논문집 2009 pp.988-991

※ 협약을 통해 무료로 제공되는 자료로, 원문이용 방식은 연계기관의 정책을 따르고 있습니다.

원문보기

게놈 데이터의 지속적인 증가로 인해 생물정보학에서 유전체 정보를 체계적으로 저장하고 열람하는 효과적이고 효율적인 시스템을 확립하는 것은 중요한 일이다. 잘 알려진 게놈 정보의 계층적 구조처럼 우리는 게놈의 내부 구조를 연구하기 위한 우수한 툴도 필요하다. 게놈 연구에 있어서 한 가지 문제는 유전체 정보는 너무 거대해서 표준적인 정보 처리를 이용하는 간단한 툴로는 작업하기 어려운 점이다. 예를 들어 특정 게놈 데이터 크기는 100메가 바이트를 넘는다. 추가적으로 유전자, promoters, retro-elements(HERV), operons, exon-introns와 같은 많은 게놈 요소들이 있다. 전통적으로 생물학자 들은 게놈 연구를 위해 툴을 아무거나 사용하지 않고, 보통 그들의 연구에 좋은 툴을 채택하려 노력했다. 게놈 연구에서 기본적이고 주시할만한 단계는 다른 종과 유전체 요소를 비교하기 위해 위치를 인식할 수 있도록 하나의 화면에 모든 게놈 데이터를 시각화하는 것이다. 생물학자에게 툴의 개발은 많은 시간이 걸리고 시행착오를 겪기 쉬운 일이다. 이 논문에서 우리는 전체 게놈 중 어떤 게놈 요소를 시각화하는 컴포넌트 웨어의 셋을 제안한다. 그리하여 실험을 목적으로 생물학자를 만나서 우리의 셋을 이용하여 컴포넌트를 조합하여 소프트웨어를 만드는 것은 비교적 간단한 작업이다. 이 실험에서 우리는 HERV와 연동되는 게놈 요소를 보여주는 툴을 어떻게 우리의 컴포넌트 웨어를 간단히 조합하여 구축하는지를 보여주겠다.

 
1 2
페이지 저장