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Flammulina velutipes var. lupinicola의 유전체 정보기반 laccase 유전자 동정 및 특성 규명
Identification and characterization of laccase genes in the Flammulina velutipes var. lupinicola genome

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  • 발행기관
    한국버섯학회 바로가기
  • 간행물
    한국버섯학회지 KCI 등재 바로가기
  • 통권
    제19권 제4호 (2021.12)바로가기
  • 페이지
    pp.285-293
  • 저자
    유혜원, 박영진
  • 언어
    한국어(KOR)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A406096

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원문정보

초록

영어
The purpose of this study was to identify and characterize the laccase genes of Flammulina velutipes var. lupinicola. Five laccase genes (g1934, g1937, g2415, g2539, g5858) were selected based on the copper binding site and signal peptide analysis results using the laccase gene selected from the F. velutipes var. lupinicola genome. The size of the laccase genes of F. velutipes var. lupinicola were 1,488 bp~1,662 bp. As a result of cDNA sequence analysis, 14 to 17 introns were identified in the laccase genes. The cleavage site predicted as the signal peptide of the laccase gene was found to be located between 20 bp and 34 bp from the N-terminus. In addition, separation and purification were performed to characterize the F. velutipes var. lupinicola laccases, and the optimal activity of the separated and purified proteins were analyzed by pH, temperature and time. Five bands with laccase activity were found from zymogram analysis. The optimal pH of the reaction was 5.5, the optimal temperature was found to be 40oC. Therefore, characterization of the laccase genes identified in this study should help in better understanding the biomass decomposition of F. velutipes var. lupinicola.

목차

ABSTRACT
서론
재료 및 방법
시험균주 및 배양
생물정보학 기반 laccase 유전자 분석
RNA 추출, cDNA 합성 및 염기서열 분석
Laccase 단백질 농축 및 이온 교환 크로마토그래피, 소수성 상호작용 크로마토그래피에 의한 분리
단백질 정량 및 laccase 효소 활성 평가
SDS-PAGE 및 zymogram 분석
온도, pH, 시간별 Laccase 효소 활성 분석
결과 및 고찰
Flammulina velutipes var. lupinicola의 유전체 정보 기반 신규 laccase 유전자 선발 및 유전적 특성 규명
Flammulina velutipes var. lupinicola의 laccase 효소활성 평가
적요
감사의 글
REFERENCES

키워드

Bioinformatics Flammulina velutipes var. lupinicola Genome Laccase

저자

  • 유혜원 [ Hye-Won Yu | 건국대학교 글로컬캠퍼스 의료생명대학 바이오의약학과 ]
  • 박영진 [ Young-Jin Park | 건국대학교 글로컬캠퍼스 의료생명대학 바이오의약학과 ] Corresponding Author

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한국버섯학회 [The Korean Society of Mushroom Science]
  • 설립연도
    1997
  • 분야
    농수해양>농학
  • 소개
    우리나라의 버섯 연구와 관련 산업의 발전에 기여하고 버섯관련 연구자와 관련산업 종사자간의 학술정보 등의 교류를 목적으로 한다.

간행물

  • 간행물명
    한국버섯학회지 [Journal of MUSHROOMS]
  • 간기
    계간
  • pISSN
    1738-0294
  • eISSN
    2288-8853
  • 수록기간
    2003~2025
  • 등재여부
    KCI 등재
  • 십진분류
    KDC 525 DDC 635

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