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InDel and SSR sequences of monokaryons which are mother strains of Pleurotus ostreatus cultivar

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  • 발행기관
    한국버섯학회 바로가기
  • 간행물
    버섯 바로가기
  • 통권
    제23권 2호 통권 40호 (2019.10)바로가기
  • 페이지
    pp.36-36
  • 저자
    Jae-San Ryu, Jong In Choi
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A364626

원문정보

초록

영어
InDel and simple sequence repeats (SSRs) were isolated from the genome sequences of 4 monokaryons which are the mother strains of “Heuktari”, Gonji 7ho, Sanatari and “Baeksun” were sequenced by HiSeq (Illunina사) sequencing technology. The total numbers of SSRs detected in the “HK18, GB19, CD54 and hyosn47 genomes were 849, 712, 783 and 711, respectively. Tri-, hexa- and octanucleotide motifs accounted for the top three fractions of SSR distributions. Conserved sequences were acquired by BLAST search with reference cds sequence to contigs’ DB of 4 cultivar. A total of 32,870 CDs were found, it used for sequence alignment to find 1,781 InDel matrix. Finally 1,581 primers were isolated after removing no polymorphism by in silico PCR reaction. These SSRs and InDels could be used as a primer for genotyping of segregation population and screening for the trait linked markers. [Supported by a grant from the IPET (213003-04-3-SBY20), MIFAFF, Republic of Korea.]

저자

  • Jae-San Ryu [ Department of mushroom science, Korea national college of agriculture and fisheries ]
  • Jong In Choi [ Mushroom Research Institute, GARES, Gwangju, 12805, Republic of Korea ]

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한국버섯학회 [The Korean Society of Mushroom Science]
  • 설립연도
    1997
  • 분야
    농수해양>농학
  • 소개
    우리나라의 버섯 연구와 관련 산업의 발전에 기여하고 버섯관련 연구자와 관련산업 종사자간의 학술정보 등의 교류를 목적으로 한다.

간행물

  • 간행물명
    버섯 [Mushroom]
  • 간기
    반년간
  • 수록기간
    1997~2025
  • 십진분류
    KDC 525 DDC 635

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