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Prediction of Binding Free Energy Calculation Using Molecular Mechanics/Poisson-Boltzmann Surface Area (MM-PBSA) Method in Drug Discovery: A Short Review

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  • 발행기관
    조선대학교 기초과학연구원 바로가기
  • 간행물
    통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) KCI 등재후보 바로가기
  • 통권
    제5권 4호 (2012.12)바로가기
  • 페이지
    pp.216-219
  • 저자
    Gugan Kothandan, Seung Joo Cho
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A189906

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원문정보

초록

영어
Structure-based drug design possibly benefit from in silico methods that precisely predict the binding affinity of small molecules to target macromolecules. There are many limitations arise from the difficulty of predicting the binding affinity of a small molecule to a biological target with the current scoring functions. There is thus a strong interest in novel methodologies based on MD simulations that claim predictions of greater accuracy than current scoring functions, helpful for a regular use designed for drug discovery in the pharmaceutical industry. Herein, we report a short review on free energy calculations using MMPBSA method a useful method in structure based drug discovery.

목차

Abstract
 1. Introduction
 2. Experimental Section
 3. Results and Discussion
  3.1. Limitations of MMPBSA
  3.2. Successful Applications of MMPBSA
 4. Conclusion
 Acknowledgements
 References

키워드

Structure-based Drug Design Molecular Dynamics MMPBSA Free Energy Calculations

저자

  • Gugan Kothandan [ Department of Biochemistry, Centre for Bioinformatics, University of Madras, Guindy campus, Guindy, Chennai-600025, India ] Corresponding author
  • Seung Joo Cho [ 조승주 | Department of Bio-New Drug Development, College of Medicine, Chosun University, Department of Cellular · Molecular Medicine, College of Medicine, Chosun University ] Corresponding author

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    조선대학교 기초과학연구원 [The Natural Science Research Institute of Chosun]
  • 설립연도
    2008
  • 분야
    자연과학>자연과학일반
  • 소개
    본 연구원은 기초과학을 진흥하기 위한 연구·교육 및 그 보급을 목적으로 한다. 이 목적을 달성하기 위하여 다음 각 호의 사업을 수행한다. 1. 기초과학 제 분야에 관한 조사와 연구 2. 기초과학에 관한 학술행사(학술대회, 학술세미나, 심포지엄, 초청강연회 등) 개최 3. 학문후속세대 및 일반인을 위한 기초과학 교육 4. 기관지『조선자연과학논문지』 발간 5. 『자연과학연구총서』, 『자연과학번역총서』 등 단행본 발간 6. 기타 본 연구원의 목적과 관련된 사업

간행물

  • 간행물명
    통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) [Journal of Integrative Natural Science]
  • 간기
    계간
  • pISSN
    2005-1042
  • 수록기간
    2008~2026
  • 등재여부
    KCI 등재
  • 십진분류
    KDC 405 DDC 505

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