현재 위치
Home
Homology Modeling and Docking Study of an Alginate Lyase, alyVI
-
- 발행기관
- 한국생물공학회 바로가기
-
- 간행물
- 한국생물공학회 학술대회 바로가기
-
- 통권
- 2008 추계학술대회 및 국제심포지움 (2008.10)바로가기
-
- 페이지
- pp.253-253
-
- 저자
-
- 언어
- 영어(ENG)
-
- URL
- https://www.earticle.net/Article/A99430
※ 원문제공기관과의 협약기간이 종료되어 열람이 제한될 수 있습니다.
원문정보
초록
- 영어
- alyVI is a gene which encodesan alginate lyase of marine bacterium Vibrio sp. QY101 (338aa). A nine-amino-acid consensus region (YXRESLREM), which was only found in poly-G lyases, was also observed in the amino-terminal region of alyVI. However, alyVI could degrade both M block and G block. A1-II’ is a close homolog with a reported structure (2CWS). A 3D structure of this enzyme was modeled based on this template by the comparative modeling technique. As in the template alginate, tyrosine seems critical for enzymatic activity. Since it shows enzymatic activity for poly-M alginate, docking a tri-mannuronate as well as a tri-guluronate into the
enzyme was performed. The ligand was nicely posed inside of the each binding site with a strikingly similar way. In accordance with previous report, OH-group of a tyrosine is close to -hydrogen, suitable to initiate -elimination reaction. By considering both ligands, it can be designed to change stereoselectivity of this enzyme to either M-specific or G-specific in
a rational way.
키워드
Homology Modeling Docking Alginate Lyase alyVI저자
간행물 정보
발행기관
-
- 발행기관명
- 한국생물공학회 [The Korean Society for Biotechnology and Bioengineering]
- 설립연도
- 1984
- 분야
- 공학>생물공학
- 소개
- 이 법인은 생물 공학의 발전과 보급에 이바지하고, 회원 상호 간의 연구 협력과 친목을 도모함을 목적으로 한다 1. 생물공학 분야의 발전을 위한 연구 협력 2. 생물공학의 실용화를 촉진시키기 위한 산학 협동 3. 학술연구 발표회, 강연회, 연수회 등 학술활동의 개최 4. 국,영문 학술지,소식지,학술회의 Proceedings 및 학술도서의 발간 5. 생물공학 발전을 위한 정책 건의 6. 기타 국제 교류 등 본 학회의 목적 달성을 위한 제반 활동
간행물
-
- 간행물명
- 한국생물공학회 학술대회
- 간기
- 반년간
- 수록기간
- 1985~2013
- 십진분류
- KDC 476 DDC 576
이 권호 내 다른 논문 / 한국생물공학회 학술대회 2008 추계학술대회 및 국제심포지움
피인용수 : 0건 (자료제공 : 네이버학술정보)
함께 이용한 논문 이 논문을 다운로드한 분들이 이용한 다른 논문입니다.
출처 : 네이버학술정보
0개의 논문이 장바구니에 담겼습니다.