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Oral Session B-3 : Biomedical Applications

Improving In-Silico Bacterial Toxin Prediction via Semi-Supervised Dataset Curation

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  • 발행기관
    한국차세대컴퓨팅학회 바로가기
  • 간행물
    한국차세대컴퓨팅학회 학술대회 바로가기
  • 통권
    ICNGC 2025 The 11th International Conference on Next Generation Computing 2025 (2025.12)바로가기
  • 페이지
    pp.334-335
  • 저자
    Sung-Yoon Ahn, Sewon Kim, Hye Won Jeong, Sang-Woong Lee, Iel Soo Bang
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A478528

원문정보

초록

영어
In this study, we propose a semi-supervised dataset curation framework that leverages both high-confidence labeled protein sequence data and automated weakly labeled protein sequence data to refine dataset quality prior to model training. The approach centers on using a pre-trained ProtBERT model to iteratively assign pseudo-labels to uncertain samples, followed by subsequent model retraining, with the goal of enhancing robustness and generalization. We anticipate that a curated dataset constructed in this way will significantly enhance toxin-classification performance— measured in accuracy, F1-score, and MCC—compared to models trained solely on manually labeled or automatically annotated data.

목차

Abstract
I. INTRODUCTION
II. RELATED WORKS
A. Semi-supervised learning
B. Protein Sequence Models
III. METHODOLOGY
ACKNOWLEDGMENT
REFERENCES

키워드

semi-supervised learning in-silico protein sequence

저자

  • Sung-Yoon Ahn [ School of Computing, Gachon University Seongnam-Si, Republic of Korea ]
  • Sewon Kim [ School of Computing,, Gachon University Seongnam-Si, Republic of Korea ]
  • Hye Won Jeong [ Department of Microbiology and Immunology Chosun University School of Dentistry Gwangju. Korea ]
  • Sang-Woong Lee [ School of Computing,, Gachon University Seongnam-Si, Republic of Korea ]
  • Iel Soo Bang [ Department of Microbiology and Immunology Chosun University School of Dentistry Gwangju. Korea ]

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한국차세대컴퓨팅학회 [Korean Institute of Next Generation Computing]
  • 설립연도
    2005
  • 분야
    공학>컴퓨터학
  • 소개
    본 학회는 차세대 PC 및 그 관련분야의 학술활동을 통하여 차세대 PC의 학문 및 기술발전을 도모하고 산업발전 및 국제협력 증진을 목적으로 한다.

간행물

  • 간행물명
    한국차세대컴퓨팅학회 학술대회
  • 간기
    반년간
  • 수록기간
    2021~2025
  • 십진분류
    KDC 566 DDC 004

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