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파킨슨병 환자의 후성유전체를 이용한 생물학적 나이 변화
Biological Age Variation Using the Epigenome in Parkinson's Disease Patients
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- 발행기관
- 조선대학교 기초과학연구원 바로가기
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- 간행물
- 통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) KCI 등재 바로가기
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- 통권
- 제18권 2호 (2025.06)바로가기
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- 페이지
- pp.57-64
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- 저자
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- 언어
- 한국어(KOR)
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- URL
- https://www.earticle.net/Article/A469260
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원문정보
초록
- 영어
- Changes in DNA methylation patterns in human genes can not only impair gene activation but also contributes to epigenetic age. To measure these changes machine learning models are used which measures the degree of changes in DNA methylation pattern. Parkinson's disease is the second most common neurodegenerative disease which affects motor function. Even though it may develop before the age of 50 due to genetic factors, the gene that causes Parkinson's disease is linked to aging, so the incidence increases with age, and most people get affected by Parkinson’s disease are over the age of 50. It is a geriatric disease that occurs in older aged people. Changes in DNA methylation patterns have been observed in patients with Parkinson's disease. Therefore, the epigenetic age of patients with Parkinson's disease was measured using Epi clock, which is one of the epigenetic clock models which was trained using 6761 CpG probes from pan tissue. Additionally, the acceleration of age was measured and changes in DNA methylation patterns were confirmed. Through this, it was confirmed that although the epigenetic age of Parkinson's disease patients accelerates, the difference is small which is approximately 1 to 5 years. Even though Hypo methylation of CpG probes increased, it was to a small extent.
목차
Abstract
1. 서론
2. 재료 및 방법
2.1. 데이터 세트 수집
2.2. 데이터 전처리
2.3. Epi clock을 사용한 후성유전학적나이 계산
2.4. 후성유전학적 나이의 가속도 계산.
2.5. 메틸화 변화
2.6. DMPA (Differential methylation Position Analysis)
2.7. pathway analysis
2.8. 데이터 통계분석 및 시각화
3. 결과 및 고찰
3.1. 데이터 세트 특성
3.2. 파킨슨병 환자의 후성유전학적 나이
3.3. 파킨슨병 환자의 CpG probes 메틸화 변화
3.4. DMPA
3.5. Pathway analysis
4. 결론
Acknowledgments
참고문헌
저자
간행물 정보
발행기관
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- 발행기관명
- 조선대학교 기초과학연구원 [The Natural Science Research Institute of Chosun]
- 설립연도
- 2008
- 분야
- 자연과학>자연과학일반
- 소개
- 본 연구원은 기초과학을 진흥하기 위한 연구·교육 및 그 보급을 목적으로 한다. 이 목적을 달성하기 위하여 다음 각 호의 사업을 수행한다. 1. 기초과학 제 분야에 관한 조사와 연구 2. 기초과학에 관한 학술행사(학술대회, 학술세미나, 심포지엄, 초청강연회 등) 개최 3. 학문후속세대 및 일반인을 위한 기초과학 교육 4. 기관지『조선자연과학논문지』 발간 5. 『자연과학연구총서』, 『자연과학번역총서』 등 단행본 발간 6. 기타 본 연구원의 목적과 관련된 사업
간행물
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- 간행물명
- 통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) [Journal of Integrative Natural Science]
- 간기
- 계간
- pISSN
- 2005-1042
- 수록기간
- 2008~2026
- 등재여부
- KCI 등재
- 십진분류
- KDC 405 DDC 505
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