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시계열 마이크로어레이 데이터를 활용한 파킨슨병의 유전자 제어 네트워크 추론
Inference of Gene Regulation Network for Parkinson’s Disease using Time-series Microarray Data

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  • 발행기관
    국제인공지능학회(구 한국인터넷방송통신학회) 바로가기
  • 간행물
    한국인터넷방송통신학회 논문지 KCI 등재 바로가기
  • 통권
    제25권 제1호 (2025.02)바로가기
  • 페이지
    pp.69-77
  • 저자
    도진환
  • 언어
    한국어(KOR)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A465071

※ 원문제공기관과의 협약기간이 종료되어 열람이 제한될 수 있습니다.

원문정보

초록

영어
In this paper, we aimed to analyze the neuronal cell death process resulting from mitochondrial dysfunction, which is one of the molecular pathological mechanisms of Parkinson's disease from the perspective of a gene regulatory network. To estimate the influence between genes, a state space model consisting of state variables and observation variables was utilized, and the parameters of the state-space model were calculated through time-series microarray data obtained from a Parkinson's disease experimental model. The gene regulatory network was constructed from the gene-gene interaction matrix calculated through the parameters of the state-space model. Fifteen genes showing a positive self-loop structure that enables continuous gene expression were observed, among which eight were hub genes. These genes are judged to play a critical role while maintaining continuous expression during the cell death process, and it is expected that they can provide insights for developing therapeutic strategies for Parkinson's disease caused by mitochondrial dysfunction.
한국어
본 논문에서는 파킨슨병의 분자병리적 기작 중 하나인 미토콘드리아 기능 장애로 인한 신경세포 사멸과정을 유전자 제어 네트워크 관점에서 분석하고자 하였다. 유전자 상호 간의 미치는 영향을 추정하기 위해 상태변수와 관측변 수로 구성된 상태공간 모델을 이용하였으며, 상태공간 모델의 파라미터는 파킨슨병 실험모델로부터 얻어진 시계열 마이 크로어레이 데이터를 통해 계산하였다. 유전자 제어 네트워크는 상태공간 모델의 파라미터를 통해 계산된 유전자-유전 자 상호작용 행렬로부터 구축되었으며, 지속적인 발현 유지를 가능하게 하는 양의 self-loop 구조를 보이는 15개 유전 자가 관측되었으며, 이 가운데 8개는 허브 유전자였다. 이들 유전자는 세포 사멸과정에서 지속적인 발현을 유지하면서 중요한 역활을 감당할 것으로 판단되며 미토콘드리아 기능 장애로 발병되는 파킨슨병에 대한 치료전략 개발에 실마리를 제공할 수 있을 것으로 기대된다.

목차

요약
Abstract
Ⅰ. 서론
Ⅱ. 본문
1. 시계열 마이크로어레이 데이터셋 및 전처리
2. 시계열 마이크로어레이 데이터 분석
Ⅲ. 결과
1. 차등 발현 유전자의 선별과 모듈 유전자 추출
2. 유전자 제어 네트워크 구축과 분석
Ⅳ. 고찰 및 결론
References

키워드

유전자 제어 네트워크 파킨슨병 시계열 마이크로어레이 데이터 상태공간 모델 Gene Regulation Network Parkinson’s Disease Time-series Microarray Data State Space Model

저자

  • 도진환 [ Jin-Hwan Do | 정회원, 동양대학교 스마트모빌리티학과 교수 ] Corresponding Author

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    국제인공지능학회(구 한국인터넷방송통신학회) [The International Association for Artificial Intelligence]
  • 설립연도
    2000
  • 분야
    공학>전자/정보통신공학
  • 소개
    인터넷방송, 인터넷 TV , 방송 통신 네트워크 및 관련 분야에 대한 국내는 물론 국제적인 학술, 기술의 진흥발전에 공헌하고 지식 정보화 사회에 기여하고자 한다.

간행물

  • 간행물명
    한국인터넷방송통신학회 논문지 [The Journal of the Institute of Internet, Broadcasting and Communication]
  • 간기
    격월간
  • pISSN
    2289-0238
  • eISSN
    2289-0246
  • 수록기간
    2001~2025
  • 십진분류
    KDC 326 DDC 380

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