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단일 세포 RNA 시퀀싱 데이터의 세포 유형 식별 방법 비교
Comparison of cell type identification methods of single cell RNA sequencing data

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  • 발행기관
    한국차세대컴퓨팅학회 바로가기
  • 간행물
    한국차세대컴퓨팅학회 학술대회 바로가기
  • 통권
    2021 한국차세대컴퓨팅학회 춘계학술대회 (2021.05)바로가기
  • 페이지
    pp.432-433
  • 저자
    Nahyun Kim, Minsu Kim, Hanbyeol Kim, Joongho Lee, Seokhyun Yoon
  • 언어
    한국어(KOR)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A409395

원문정보

초록

한국어
단일 세포 RNA 시퀀싱은 세포 하나의 유전자 발현량을 측정하는 기술이다. 전체 세포에 대한 유전자 발현을 평균으로 하는 Bulk 시퀀싱과 달리 단일 세포에서 유전자 발현을 측정하는 기술이며, 특정 조직의 면역세포 분포에 관한 연구, 암 조직을 구성하는 세포들의 유형 연구 등, 다양한 연구 분야에 이용될 수 있다. 하지만, 단일 세포 RNA 시퀀싱 기술에서 얻어진 데이터는 세포의 유형이 구분되어 있지 않으며, 세포 유형을 식별하는 방법이 필요하다. 이를 위한 다양한 방법과 소프트웨어가 개발되었다. 그러나 실제 세포 유형을 올바르게 식별하는 것은 여전히 어려운 일이다. 본 논문에서는 이미 잘 알려진 소프트웨어들을(scSorter, SCINA) 이용하여 세포 유형 예측성능을 비교하였다.

목차

Abstract
1. Introduction
2. Methods
2.1. 데이터 소개
2.2. 분석 방법
3. Result
Acknowledgement
References

키워드

Bioinformatics Single cell RNA sequencing Cell type Data analysis Algorithm

저자

  • Nahyun Kim [ Dankook University Microbiology Cheonan, South Korea ]
  • Minsu Kim [ Dankook University Software Convergence Jukjeon, South Korea ]
  • Hanbyeol Kim [ Dankook University Computer Engineering Jukjeon, South Korea ]
  • Joongho Lee [ Dankook University Computer Engineering Jukjeon, South Korea ]
  • Seokhyun Yoon [ Dankook University Electronics and Electrical Engineering Jukjeon, South Korea ] Corresponding author

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한국차세대컴퓨팅학회 [Korean Institute of Next Generation Computing]
  • 설립연도
    2005
  • 분야
    공학>컴퓨터학
  • 소개
    본 학회는 차세대 PC 및 그 관련분야의 학술활동을 통하여 차세대 PC의 학문 및 기술발전을 도모하고 산업발전 및 국제협력 증진을 목적으로 한다.

간행물

  • 간행물명
    한국차세대컴퓨팅학회 학술대회
  • 간기
    반년간
  • 수록기간
    2021~2025
  • 십진분류
    KDC 566 DDC 004

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