Earticle

현재 위치 Home

3D-QSAR, Docking and Molecular Dynamics Simulation Study of C-Glycosylflavones as GSK-3β Inhibitors

첫 페이지 보기
  • 발행기관
    조선대학교 기초과학연구원 바로가기
  • 간행물
    통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) KCI 등재 바로가기
  • 통권
    제13권 4호 (2020.12)바로가기
  • 페이지
    pp.170-180
  • 저자
    Suparna Ghosh, Seketoulie Keretsu, Seung Joo Cho
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A388950

※ 기관로그인 시 무료 이용이 가능합니다.

4,200원

원문정보

초록

영어
Abnormal regulation, hyperphosphorylation, and aggregation of the tau protein are the hallmark of several types of dementia, including Alzheimer's Disease. Increased activity of Glycogen Synthase Kinase-3β (GSK-3β) in the Central Nervous System (CNS), increased the tau hyperphosphorylation and caused the neurofibrillary tangles (NFTs) formation in the brain cells. Over the last two decades, numerous adenosine triphosphate (ATP) competitive inhibitors have been discovered that show inhibitory activity against GSK-3β. But these compounds exhibited off-target effects which motivated researchers to find new GSK-3β inhibitors. In the present study, we have collected the dataset of 31 C-Glycosylflavones derivatives that showed inhibitory activity against GSK-3β. Among the dataset, the most active compound was docked with the GSK-3β and molecular dynamics (MD) simulation was performed for 50 ns. Based on the 50 ns MD pose of the most active compound, the other dataset compounds were sketched, minimized, and aligned. The 3D-QSAR based Comparative Molecular Field Analysis (CoMFA) model was developed, which showed a reasonable value of q 2=0.664 and r 2=0.920. The contour maps generated based on the CoMFA model elaborated on the favorable substitutions at the R2 position. This study could assist in the future development of new GSK-3β inhibitors.

목차

Abstract
Introduction
Methodology
Molecular Docking
Molecular Dynamics (MD) Simulation and Data Analysis
CoMFA
Results and Discussions
Molecular Docking Analysis
MD Simulation and MM/PBSA Analysis
CoMFA Model Study
Conclusion
Acknowledgment
References

키워드

Alzheimer's Disease Kinase Molecular Docking Molecular Dynamics MM/PBSA CoMFA

저자

  • Suparna Ghosh [ Department of Biomedical Sciences, College of Medicine, Chosun University ]
  • Seketoulie Keretsu [ Department of Biomedical Sciences, College of Medicine, Chosun University ]
  • Seung Joo Cho [ Department of Biomedical Sciences, College of Medicine, Chosun University, Department of Cellular Molecular Medicine, College of Medicine, Chosun University, ] Corresponding Author

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    조선대학교 기초과학연구원 [The Natural Science Research Institute of Chosun]
  • 설립연도
    2008
  • 분야
    자연과학>자연과학일반
  • 소개
    본 연구원은 기초과학을 진흥하기 위한 연구·교육 및 그 보급을 목적으로 한다. 이 목적을 달성하기 위하여 다음 각 호의 사업을 수행한다. 1. 기초과학 제 분야에 관한 조사와 연구 2. 기초과학에 관한 학술행사(학술대회, 학술세미나, 심포지엄, 초청강연회 등) 개최 3. 학문후속세대 및 일반인을 위한 기초과학 교육 4. 기관지『조선자연과학논문지』 발간 5. 『자연과학연구총서』, 『자연과학번역총서』 등 단행본 발간 6. 기타 본 연구원의 목적과 관련된 사업

간행물

  • 간행물명
    통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) [Journal of Integrative Natural Science]
  • 간기
    계간
  • pISSN
    2005-1042
  • 수록기간
    2008~2026
  • 등재여부
    KCI 등재
  • 십진분류
    KDC 405 DDC 505

이 권호 내 다른 논문 / 통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) 제13권 4호

    피인용수 : 0건 (자료제공 : 네이버학술정보)

    함께 이용한 논문 이 논문을 다운로드한 분들이 이용한 다른 논문입니다.

      출처 : 네이버학술정보

        0개의 논문이 장바구니에 담겼습니다.

        페이지 저장
        소속기관 조회
        이용자님의 소속기관(단체)이 서비스에 가입되어 있는지 확인해 보십시오.
        기관회원에 소속되어 있는 이용자는 원문을 무료로 이용할 수 있습니다.