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순종 랜드레이스의 10주령 체중 형질에 영향을 미치는 후보유전자 탐색을 위한 전장유전체 분석
Genome-wide Association Study Analysis for Explore of Candidate Genes Affecting Weight of 10 Week Old Traits in Purebred Landrace
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- 발행기관
- 강원대학교 동물생명과학연구소(구 강원대학교 동물자원공동연구소) 바로가기
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- 간행물
- 동물자원연구 KCI 등재 바로가기
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- 통권
- 제30권 3호 (2019.09)바로가기
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- 페이지
- pp.97-104
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- 저자
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- 언어
- 한국어(KOR)
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- URL
- https://www.earticle.net/Article/A363148
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원문정보
초록
- 영어
- According to Livestock Inspection Standards, the piglets enter the feedlot at approximately 30 kg, and the inspection starts after the preliminary feeding period. The reason for applying the preliminary feeding period is to select inspection piglets with no diseases after the complete growth of the internal organs until 10 weeks of age. Furthermore, the age of 10 week is the time when the muscle fibers grow to their maximum size and the piglets are prepared for fat deposition at the later fattening period. In the study, a genome-wide association study (GWAS) was performed through the mlma command of the genome-wide complex trait analysis (GCTA) program with 703 purebred Landrace population, and the candidate genes associated with the weight of 10 week were searched. The GWAS identified 3 single nucleotide polymorphism (SNP) markers, which have a significant genome-wide suggestive level, on chromosome 6 (DIAS0002615; p value=1.62×10-6, MARC0083933; p value=4.94×10-6, ASGA0028717; p value=5.40×10-6). The 2 genes (Ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 4; UBR4, WD and tetratricopeptide repeats 1; WDTC1) in which these 3 SNP markers are located are positional candidate genes of the weight of 10 week of the purebred Landrace population. 2 candidate genes have been reported to be associated with fattening. Therefore, the positional candidate genes in this study, UBR4 and WDTC1, are expected to be usable as genes for traits associated with the weight of 10 week weight and fattening through additional experimental research with other population.
목차
ABSTRACT
Ⅰ. 서론
Ⅱ. 재료 및 방법
1. 공시 동물 및 DNA 추출
2. 10주령 체중 형질 측정
3. 데이터 기초분석 및 전장유전체 연관성 분석
Ⅲ. 결과 및 고찰
Ⅳ. 요약
사사
Ⅴ. 참고문헌
키워드
Candidate gene Genome-wide association study Purebred landrace Single nucleotide polymorphism marker Weight of 10 week저자
간행물 정보
발행기관
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- 발행기관명
- 강원대학교 동물생명과학연구소(구 강원대학교 동물자원공동연구소) [Institute of Animal Life Science Kangwon National University]
- 설립연도
- 1999
- 분야
- 농수해양>축산학
- 소개
- 1970년 3월에 설립된 본 연구소는 국내외 동물자원에 관한 기초 및 응용연구를 통하여 축산업 발전을 선도하고 산학협동 체제를 강화하여 지역사회 발전에 기여함은 물론 통일에 대비한 북한 동물자원에 관한 연구를 체계적으로 수행하기 위함을 근본 목적으로 하고 있다. 본 연구소는 다변화, 과학화된 동물자원 분야에서 이론과 실제를 결부하는 연구활동 뿐만 아니라 학술 및 산학협동 활동 등을 인정받아 1991년에 교육부로부터 법정 연구소로 지정되었으며 1996년에는 이공계 첨단기자재 지원대상 연구소, 한우특성화대학 연구소로 지정되었고 1999년에는 학술진흥재단 대학 부설 중점연구소로 지정되었다. 이러한 지원과 국내외 동물자원 분야의 과학적 정립 및 연구, 발전이라는 고유한 목적 하에서 현재 국제적으로 축산업분야 중 심각한 문제를 가지고 있는 전염성 질병 및 그 대책 마련 등의 연구를 통해 현장애로 및 문제점을 해결하고, 실용적 축산 분뇨처리 방법 개발 및 새로운 축산물 가공품 개발과 유전공학 기법을 이용한 새로운 동물의 작출, 유전적 능력이 우수한 개체의 생산과 육종, 새로운 사료자원의 개발 등의 분야에서 세계적으로 선도적인 연구를 수행하고 있으며 관련분야에서 인정받는 국제적인 연구소로 발전하기 위해 노력을 기울이고 있다.
간행물
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- 간행물명
- 동물자원연구 [Annals of Animal Resources Sciences]
- 간기
- 계간
- pISSN
- 1225-2964
- eISSN
- 2287-3317
- 수록기간
- 1999~2026
- 등재여부
- KCI 등재
- 십진분류
- KDC 527 DDC 636
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