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HCoV-IMDB: Database for the Analysis of Interactions between HCoV and Host Immune Proteins

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  • 발행기관
    국제인공지능학회(구 한국인터넷방송통신학회) 바로가기
  • 간행물
    The International Journal of Advanced Smart Convergence KCI 등재 바로가기
  • 통권
    Volume 8 Number 1 (2019.03)바로가기
  • 페이지
    pp.1-8
  • 저자
    Mi-Ran Kim, Ji-Hae Lee, Hyeon Seok Son, Hayeon Kim
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A351876

※ 원문제공기관과의 협약기간이 종료되어 열람이 제한될 수 있습니다.

원문정보

초록

영어
Coronaviruses are known respiratory pathogens. In the past, most human coronaviruses were thought to cause mild symptoms such as cold. However recently, as seen in the Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) and the Middle East Respiratory Syndrome (MERS), infectious diseases with severe pulmonary disease and respiratory symptoms are caused by coronaviruses, making research on coronaviruses become important. Considering previous studies, we constructed ‘HCoV-IMDB (Human Corona Virus Immune Database)’ to systematically provide genetic information on human coronavirus and host immune information, which can be used to analyze the interaction between human coronavirus and host immune proteins. The ‘HCoV-IMDB’ constructed in the study can be used to search for genetic information on human coronavirus and host immune protein and to download data. A BLAST search specific to the human coronavirus, one of the database functions, can be used to infer genetic information and evolutionary relationship about the query sequence.

목차

Abstract
1. Introduction
2. Methods
3. Results
3.1 HCoV-IMDB
3.2 BLAST search based on ‘HCoV-IMDB’
3.3 Phylogenetic analysis using data in ‘HCoV-IMDB’
4. Discussion
5. Conclusion
Acknowledgement
References

키워드

Database Coronavirus Immune-protein Bioinformatics

저자

  • Mi-Ran Kim [ Special Chemistry, Laboratory Medicine, Asan Medical Center, Seoul, Korea ]
  • Ji-Hae Lee [ Bioinforamtion Technology Division, Bioresources Industrialization Support Department, Nakdonggang National Institute of Biological Resources, Sangju, Gyeongsangbukdo, Korea ]
  • Hyeon Seok Son [ Laboratory of Computational Biology & Bioinformatics, Institute of Public Health and Environment, Graduate School of Public Health, Seoul National University, Seoul, Korea ]
  • Hayeon Kim [ Department of Biomedical Laboratory Science, Kyungdong University, Wonju, Gangwondo, Korea ] Corresponding author

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    국제인공지능학회(구 한국인터넷방송통신학회) [The International Association for Artificial Intelligence]
  • 설립연도
    2000
  • 분야
    공학>전자/정보통신공학
  • 소개
    인터넷방송, 인터넷 TV , 방송 통신 네트워크 및 관련 분야에 대한 국내는 물론 국제적인 학술, 기술의 진흥발전에 공헌하고 지식 정보화 사회에 기여하고자 한다.

간행물

  • 간행물명
    The International Journal of Advanced Smart Convergence
  • 간기
    계간
  • pISSN
    2288-2847
  • eISSN
    2288-2855
  • 수록기간
    2012~2025
  • 십진분류
    KDC 326 DDC 380

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