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Poster Presentation : Gene Expression / Function

Identifying the Imprinting Pattern of Porcine GNAS Complex Locus by an Efficient Strategy using RNA-seq of Parthenogenetic Fetuses

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  • 발행기관
    한국동물생명공학회(구 한국동물번식학회) 바로가기
  • 간행물
    발생공학 국제심포지엄 및 학술대회 바로가기
  • 통권
    2018년 한국동물번식학회, 한국수정란이식학회 공동학술대회 (2018.06)바로가기
  • 페이지
    pp.49-49
  • 저자
    Seongsoo Hwang, In-Sul Hwang, Mi Ryung Park, Jeong Hee Yoon, Jeong-Woong Lee, Kichoon Lee, Gi Sun Im
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A347443

원문정보

초록

영어
Understanding the sophisticated imprinting pattern is the first challenge for deciphering the molecular mechanism of an imprinted gene. However, the determination of imprinted genes, and their methylation status in pigs, remains inefficient at present. Herein, for the first time, we have made an attempt to illustrate the complex imprinting pattern of porcine GNAS complex locus by an efficient strategy using RNA-seq analysis of parthenogenetic fetuses containing no paternal allele, but two maternal alleles. RNA-seq results showed that Nespas, Gnasxl, and Exon 1A genes expressed at extremely lower levels (p<0.05) in parthenogenetic fetuses compared to the normally fertilized fetuses, suggest these three genes are paternally-expressed. Whereas, the expression levels of Gnas were similar in both groups, suggesting biallelic expression of Gnas. The parental-specific expression of these genes was further confirmed by quantitative real-time PCR. Bisulfite sequencing revealed that the maternally derived Nespas promoter was methylated, but the paternal chromosome was not methylated. Our finding provided full-scale imprinting information on porcine GNAS locus for the first time. Furthermore, our study is useful for identify novel imprinted genes, confirm the previously known imprinted genes, and determine imprinting pattern efficiently.

키워드

Pig GNAS complex locus Imprinted gene DNA methylation Parthenogenetic fetuses

저자

  • Seongsoo Hwang [ Animal Biotechnology Division, NIAS, Wanju 55365, Korea ]
  • In-Sul Hwang [ Animal Biotechnology Division, NIAS, Wanju 55365, Korea ]
  • Mi Ryung Park [ Animal Biotechnology Division, NIAS, Wanju 55365, Korea ]
  • Jeong Hee Yoon [ Animal Biotechnology Division, NIAS, Wanju 55365, Korea ]
  • Jeong-Woong Lee [ Biotherapeutics Translational Research Center, KRIBB, Daejeon 34141, Korea ]
  • Kichoon Lee [ Department of Animal Sciences, The Ohio State University, OH 43210, USA ]
  • Gi Sun Im [ Animal Biotechnology Division, NIAS, Wanju 55365, Korea ]

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한국동물생명공학회(구 한국동물번식학회) [The Korean Society of Animal Reproduction and Biotechnology]
  • 설립연도
    1976
  • 분야
    농수해양>축산학
  • 소개
    동물번식생리학, 동물생명공학, 수의학, 인공수정 및 수정란이식을 이용한 동물개량에 관한 이론과 기술의 발전을 통해 학계, 연구계, 산업계 및 양축가 상호간의 협력을 도모함으로써 동물과학발전 및 사회일반의 이익에 기여 한다는 목적을 위해 노력해 나가겠습니다.

간행물

  • 간행물명
    발생공학 국제심포지엄 및 학술대회 [International Symposium on Developmental Biotechnology]
  • 간기
    연간
  • 수록기간
    2004~2018
  • 십진분류
    KDC 527 DDC 636

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