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초록

영어

To search of a new porcine pheromonal odorants, the comparative molecular similarity indices analysis (CoMSIA) between porcine odorant binding protein (pOBP) as receptor and ligands of green odorants 2-(cyclohexyloxy)tetrahydrofurane derivatives as substrate molecule were conducted and disscused quantitatively. In the optimized CoMSIA model (I-AI) with chirality (I: C1'(R), C2(S)) in substrate molecules and atom based fit alignment (AF) of the odorants, the statistical PLS results showed the best predictability of the binding affinities based on the LOO cross-validated value r2cv. (q2=0.856) and non cross-validated conventional coefficient (r2ncv.= 0.964). The structural distinctions of the highest active molecules were able to understand from the interaction between pOBP and green odorants in the contour maps with CoMSIA model.

한국어

돼지 페르몬성 분자를 탐색하기 위하여 일련의 green odorant로서 기질 분자인 2-(cyclohexyloxy)tetrahydrofurane 유도체들의 정량적인 구조와 수용체인 porcine odorant binding protein (pOBP) 사이의 결합 친화력 상수(p(Od)50)에 대한 비교 분자 유사성 지수 분석(CoMSIA)을 실행하였다. 가장 양호한 CoMSIA 모델(I-AI)은 기질 분자내 입체 중심의 절대 배열이 I: C1'(R),C2(S)인 분자를 atom based fit 정렬하였을 경우의 입체장 조건에서 유도되었으며 PLS 분석 결과, 예측성이 r2cv.(q2)=0.856 그리고 적합성이 r2ncv.=0.964이었다. 모델의 CoMSIA 등고도 상, pOBP와 냄새 분자 사이의 상호작용으로부터 가장 높은 결합 친화력을 나타내는 분자의 구조적 특징들을 이해할 수 있었다.

목차

ABSTRACT
 요약
 서론
 재료 및 방법
 결과
 고찰
 인용문헌

키워드

저자

• 성낙도 [ Nack-Do sung | 충남대학교 농업생명과학대학 응용생물화학부 ]
• 박창식 [ Chang-Sik park | 형질전환복제돼지연구센터, 동물자원학부 ]
• 장석찬 [ Seok-Chan Jang | 충남대학교 농업생명과학대학 응용생물화학부 ]
• 최경섭 [ Kyung-Seob choi | 충남대학교 농업생명과학대학 응용생물화학부 ]

참고문헌

발행기관

간행물

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• 간행물명

  Reproductive & developmental biology

• 간기

  계간

• pISSN

  1738-2432

• eISSN

  2288-0151

• 수록기간

  1977~2018

• 십진분류

  KDC 527 DDC 636