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느타리버섯 품종 ‘흑타리’와 ‘미소’의 초위성체 특성구명
Characterization of simple sequence repeats in the Pleurotus ostreatus cultivars, ‘Heuktari’ and ‘Miso’

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  • 발행기관
    한국버섯학회 바로가기
  • 간행물
    한국버섯학회지 바로가기
  • 통권
    제14권 제4호 (2016.12)바로가기
  • 페이지
    pp.174-178
  • 저자
    박보경, 하병석, 김민근, 이병주, 최종인, 류재산
  • 언어
    한국어(KOR)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A292476

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원문정보

초록

영어
Simple sequence repeats (SSR), also referred to “microsatellites” consist of tandemly repeated short DNA sequence motifs and have been applied in various marker-based studies. SSRs were isolated and characterized from ‘Heuktari’ and ‘Miso’, which are major oyster mushroom cultivars in Korea, by genome sequencing and bioinformatic analysis. The genome sizes of ‘Heuktari’ and ‘Miso’ were estimated to be 40.8 and 40.3 Mb, respectively, which are larger than those of other P. ostreatus species (PC9 and PC10) and smaller than those of P. eryngii (KNR2312P5). In total, 949 and 968 SSRs were found in the ‘Heuktari’ and ‘Miso’ genomes, respectively. Comparative analysis of five mushrooms including P. ostreatus var. florida (PC9 and PC15) and P. eryngii revealed that the number of SSRs in ‘Heuktari’ and ‘Miso’ were the highest among them. All mushrooms studied showed similar SSR distribution patterns. Tri-, hexa-, and octanucleotide motifs accounted for the top three fractions of all SSRs.

목차

ABSTRACT
 서론
  흑타리와 미소 유래 단핵균사의 유전체 특성
  SSR 분포와 특징
 적요
 References

키워드

Simple sequence repeat Pleurotus ostreatus Mushroom Molecular marker

저자

  • 박보경 [ Bokyung Park | 경상남도농업기술원 ]
  • 하병석 [ Byeong Seok Ha | 경상남도농업기술원 ]
  • 김민근 [ Min Keun Kim | 경상남도농업기술원 ]
  • 이병주 [ Byungjoo Lee | 충북농업기술원 ]
  • 최종인 [ Jong In Choi | 경기도농업기술원 ]
  • 류재산 [ Jae-San Ryu | 경상남도농업기술원 ] Corresponding author

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한국버섯학회 [The Korean Society of Mushroom Science]
  • 설립연도
    1997
  • 분야
    농수해양>농학
  • 소개
    우리나라의 버섯 연구와 관련 산업의 발전에 기여하고 버섯관련 연구자와 관련산업 종사자간의 학술정보 등의 교류를 목적으로 한다.

간행물

  • 간행물명
    한국버섯학회지 [Journal of MUSHROOMS]
  • 간기
    계간
  • pISSN
    1738-0294
  • eISSN
    2288-8853
  • 수록기간
    2003~2025
  • 등재여부
    KCI 등재
  • 십진분류
    KDC 525 DDC 635

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