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In silico Analysis of Natural Compounds as Modulators of Type I Collagen

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  • 발행기관
    조선대학교 기초과학연구원 바로가기
  • 간행물
    통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) KCI 등재 바로가기
  • 통권
    제9권 3호 (2016.09)바로가기
  • 페이지
    pp.166-170
  • 저자
    Radhakrishnan Narayanaswamy, Lam Kok Wai, Norhaizan Mohd Esa, Intan Safinar Ismail
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A285398

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원문정보

초록

영어
Collagen plays a vital role in the maintenance of structure and function of a human body. It has been widely applied in various fields including biomedical, cosmeceutical, food, pharmaceutical and tissue engineering. In the present study, the docking behaviour of type I collagen with 15 different ligands namely hydroxymethylfurfural, methylglyoxal, methylsyringate, O-methoxyacetophenone, 3-phenyllactic acid, 4- hydroxybenzoic acid, kojic acid, lumichrome, galangin, artoindonesianin F, caffeic acid, 4-coumaric acid, origanol A, thymoquinone and quercetin was evaluated along with their putative binding sites using Discovery Studio Version 3.1. Docking studies and binding free energy calculations revealed that origanol A has maximum interaction energy (-40.48 kcal/mol) and quercetin with the least interaction energy (-15.44 kcal/mol) as compared to the other investigated ligands. Three ligands which are galangin, methylsyringate and origanol A were shown to interact with Asp21 amino acid residue of chain B (type I collagen). Therefore, it is strongly suggested that the outcomes from the present study might provide new insight in understanding these 15 ligands as potential type I collagen modulators for the prevention of collagen associate disorders.

목차

Abstract
 1. Introduction
 2. Materials and methods
  2.1. Ligands Preparation
  2.2. Target Protein Preparation
  2.3. Docking Studies
 3. Results and Discussion
 4. Conclusion
 References

키워드

Collagen 4-coumaric acid Kojic acid Origanol A Quercetin Docking

저자

  • Radhakrishnan Narayanaswamy [ Department of Nutrition and Dietetics, Faculty of Medicine and Health Sciences, Universiti Putra Malaysia, 43400 UPM Serdang, Selangor, Malaysia, Laboratory of Natural Products, Institute of Bioscience (IBS), Universiti Putra Malaysia (UPM), 43400 Serdang, Selangor, Malaysia ] Corresponding author
  • Lam Kok Wai [ Faculty of Pharmacy, Universiti Kebangsaan Malaysia (UKM), Jalan Raja Muda Abdul Aziz, 50300 Kuala Lumpur, Malaysia ]
  • Norhaizan Mohd Esa [ Department of Nutrition and Dietetics, Faculty of Medicine and Health Sciences, Universiti Putra Malaysia, 43400 UPM Serdang, Selangor, Malaysia ]
  • Intan Safinar Ismail [ Laboratory of Natural Products, Institute of Bioscience (IBS), Universiti Putra Malaysia (UPM), 43400 Serdang, Selangor, Malaysia ]

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    조선대학교 기초과학연구원 [The Natural Science Research Institute of Chosun]
  • 설립연도
    2008
  • 분야
    자연과학>자연과학일반
  • 소개
    본 연구원은 기초과학을 진흥하기 위한 연구·교육 및 그 보급을 목적으로 한다. 이 목적을 달성하기 위하여 다음 각 호의 사업을 수행한다. 1. 기초과학 제 분야에 관한 조사와 연구 2. 기초과학에 관한 학술행사(학술대회, 학술세미나, 심포지엄, 초청강연회 등) 개최 3. 학문후속세대 및 일반인을 위한 기초과학 교육 4. 기관지『조선자연과학논문지』 발간 5. 『자연과학연구총서』, 『자연과학번역총서』 등 단행본 발간 6. 기타 본 연구원의 목적과 관련된 사업

간행물

  • 간행물명
    통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) [Journal of Integrative Natural Science]
  • 간기
    계간
  • pISSN
    2005-1042
  • 수록기간
    2008~2026
  • 등재여부
    KCI 등재
  • 십진분류
    KDC 405 DDC 505

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