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Protein Phosphatase 1D (PPM1D) Structure Prediction Using Homology Modeling

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  • 발행기관
    조선대학교 기초과학연구원 바로가기
  • 간행물
    통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) KCI 등재 바로가기
  • 통권
    제9권 1호 (2016.03)바로가기
  • 페이지
    pp.35-40
  • 저자
    Santhosh Kumar Nagarajan, Thirumurthy Madhavan
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A267300

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원문정보

초록

영어
Protein phosphatase manganese dependent 1D (PPM1D) is one of the Ser/Thr protein phosphatases belongs to the PP2C family. They play an important role in cancer tumorigenesis of various tumors including neuroblastoma, pancreatic adenocarcinoma, medulloblastoma, breast cancer, prostate cancer and ovarian cancer. Even though PPM1D is involved in the pathophysiology of various tumors, the three dimensional protein structure is still unknown. Hence in the present study, homology modelling of PPM1D was performed. 20 different models were modelled using single- and multipletemplate based homology modelling and validated using different techniques. Best models were selected based on the validation. Three models were selected and found to have similar structures. The predicted models may be useful as a tool in studying the pathophysiological role of PPM1D.

목차

Abstract
 1. Introduction
 2. Material and Methods
  2.1. Template Selection
  2.2. Homology Modelling
 3. Results and Discussion
  3.1. Model Generation
  3.2. Model Validation
 4. Conclusion
 References

키워드

PPM1D WIP1 PP2C Homology Modelling.

저자

  • Santhosh Kumar Nagarajan [ Department of Bioinformatics, School of Bioengineering, SRM University, SRM Nagar, Kattankulathur, Chennai 603203, India ]
  • Thirumurthy Madhavan [ Department of Bioinformatics, School of Bioengineering, SRM University, SRM Nagar, Kattankulathur, Chennai 603203, India ] Corresponding author

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    조선대학교 기초과학연구원 [The Natural Science Research Institute of Chosun]
  • 설립연도
    2008
  • 분야
    자연과학>자연과학일반
  • 소개
    본 연구원은 기초과학을 진흥하기 위한 연구·교육 및 그 보급을 목적으로 한다. 이 목적을 달성하기 위하여 다음 각 호의 사업을 수행한다. 1. 기초과학 제 분야에 관한 조사와 연구 2. 기초과학에 관한 학술행사(학술대회, 학술세미나, 심포지엄, 초청강연회 등) 개최 3. 학문후속세대 및 일반인을 위한 기초과학 교육 4. 기관지『조선자연과학논문지』 발간 5. 『자연과학연구총서』, 『자연과학번역총서』 등 단행본 발간 6. 기타 본 연구원의 목적과 관련된 사업

간행물

  • 간행물명
    통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) [Journal of Integrative Natural Science]
  • 간기
    계간
  • pISSN
    2005-1042
  • 수록기간
    2008~2026
  • 등재여부
    KCI 등재
  • 십진분류
    KDC 405 DDC 505

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