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A Comparative Study of Genetic Variations between Dengue Virus Subtypes 1 and 2

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  • 발행기관
    보안공학연구지원센터(IJBSBT) 바로가기
  • 간행물
    International Journal of Bio-Science and Bio-Technology SCOPUS 바로가기
  • 통권
    Vol.7 No.6 (2015.12)바로가기
  • 페이지
    pp.25-32
  • 저자
    Jin-Hwa Jang, Youngmahn Han, Insung Ahn
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A266668

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원문정보

초록

영어
Because of global climate change, mosquitos which are vectors for the dengue virus (DENV) are increasing in population and the incidence of dengue fever and dengue hemorrhagic fever is increasing every year in countries not only in the subtropics but also in other regions worldwide. There are 4 subtypes of DENV, each differing in infectivity and virulence. This study compared and analyzed genetic variation in the genomic sequences of DENV subtypes 1 and 2. The results showed that while non-synonymous codon variation was high in DENV-1, synonymous codon variation was also high in DENV-2. Additionally, there were differences in the genetic variation in each subtype according to the year or region, and incidence levels increased during periods when sequence variation was high. The results of this study can be used to compare the subtype-specific genetic variation characteristics of DENV to predict the incidence rates and sequence variations of DENV according to the region or year.

목차

Abstract
 1. Introduction
 2. Materials and Methods
  2.1 Collection of Nucleotide Sequence
  2.2 Phylogenetic Analysis
  2.3 Comparison of Codon Substitution Pattern
 3. Results
 4. Discussion and Conclusions
 References

키워드

Dengue virus bioinformatics whole genome phylogeny codon variation

저자

  • Jin-Hwa Jang [ Biomedical Prediction Technology Laboratory, Korea Institute of Science and Technology Information, Laboratory of Computational Biology and Bioinformatics, Institute of Public Health and Environment, Graduate School of Public Health, Seoul National University, 1 Gwanak-ro, Gwanak-gu, Seoul 151-742, Republic of Korea ]
  • Youngmahn Han [ Biomedical Prediction Technology Laboratory, Korea Institute of Science and Technology Information, 245 Daehak-ro, Yuseong-gu, Daejeon 305-806, Republic of Korea ]
  • Insung Ahn [ Biomedical Prediction Technology Laboratory, Korea Institute of Science and Technology Information, 245 Daehak-ro, Yuseong-gu, Daejeon 305-806, Republic of Korea ] Corresponding Author

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    보안공학연구지원센터(IJBSBT) [Science & Engineering Research Support Center, Republic of Korea(IJBSBT)]
  • 설립연도
    2006
  • 분야
    공학>컴퓨터학
  • 소개
    1. 보안공학에 대한 각종 조사 및 연구 2. 보안공학에 대한 응용기술 연구 및 발표 3. 보안공학에 관한 각종 학술 발표회 및 전시회 개최 4. 보안공학 기술의 상호 협조 및 정보교환 5. 보안공학에 관한 표준화 사업 및 규격의 제정 6. 보안공학에 관한 산학연 협동의 증진 7. 국제적 학술 교류 및 기술 협력 8. 보안공학에 관한 논문지 발간 9. 기타 본 회 목적 달성에 필요한 사업

간행물

  • 간행물명
    International Journal of Bio-Science and Bio-Technology
  • 간기
    격월간
  • pISSN
    2233-7849
  • 수록기간
    2009~2016
  • 등재여부
    SCOPUS
  • 십진분류
    KDC 505 DDC 605

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