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3D-QSAR Studies on 2-(indol-5-yl)thiazole Derivatives as Xanthine Oxidase (XO) Inhibitors

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  • 발행기관
    조선대학교 기초과학연구원 바로가기
  • 간행물
    통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) KCI 등재 바로가기
  • 통권
    제8권 4호 (2015.12)바로가기
  • 페이지
    pp.258-266
  • 저자
    Santhosh Kumar Nagarajan, Thirumurthy Madhavan
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A259793

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원문정보

초록

영어
Xanthine Oxidase is an enzyme, which oxidizes hypoxanthine to xanthine, and xanthine to uric acid. It is widely distributed throughout various organs including the liver, gut, lung, kidney, heart, brain and plasma. It is involved in gout pathogenesis. In this study, we have performed Comparative Molecular Field Analysis (CoMFA) on a series of 2-(indol- 5-yl) thiazole derivatives as xanthine oxidase (XO) inhibitors to identify the structural variations with their inhibitory activities. Ligand based CoMFA models were generated based on atom-by-atom matching alignment. In atom-by-atom matching, the bioactive conformation of highly active molecule 11 was generated using systematic search. Compounds were aligned using the bioactive conformation and it is used for model generation. Different CoMFA models were generated using different alignments and the best model yielded a cross-validated q2 of 0.698 with five components and non-cross-validated correlation coefficient (r2) of 0.992 with Fisher value as 236.431, and an estimated standard error of 0.068. The predictive ability of the best CoMFA models was found to be r2 pred 0.653. The CoMFA study revealed that the R3 position of the structure is important in influencing the biological activity of the inhibitors. Electro positive groups and bulkier substituents in this position enhance the biological activity.

목차

Abstract
 1. Introduction
 2. Materials and Methods
  2.1. Data Set
  2.2. Partial Atomic Charge Calculation and Bioactive Conformation Determination
  2.3. CoMFA Model Calculation
  2.4. Partial Least Squares (PLS) Analysis
  2.5. Predictive Correlation Coefficient
  2.6. CoMFA Contour Maps
 3. Results and Discussion
  3.1. CoMFA Model Analysis
  3.2. Mapping of CoMFA Contour Maps
 4. Conclusion
 References

키워드

Xanthine Oxidase Gout 3D-QSAR CoMFA

저자

  • Santhosh Kumar Nagarajan [ Department of Bioinformatics, School of Bioengineering, SRM University, SRM Nagar, Kattankulathur, Chennai 603203, India ]
  • Thirumurthy Madhavan [ Department of Bioinformatics, School of Bioengineering, SRM University, SRM Nagar, Kattankulathur, Chennai 603203, India ] Corresponding author

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    조선대학교 기초과학연구원 [The Natural Science Research Institute of Chosun]
  • 설립연도
    2008
  • 분야
    자연과학>자연과학일반
  • 소개
    본 연구원은 기초과학을 진흥하기 위한 연구·교육 및 그 보급을 목적으로 한다. 이 목적을 달성하기 위하여 다음 각 호의 사업을 수행한다. 1. 기초과학 제 분야에 관한 조사와 연구 2. 기초과학에 관한 학술행사(학술대회, 학술세미나, 심포지엄, 초청강연회 등) 개최 3. 학문후속세대 및 일반인을 위한 기초과학 교육 4. 기관지『조선자연과학논문지』 발간 5. 『자연과학연구총서』, 『자연과학번역총서』 등 단행본 발간 6. 기타 본 연구원의 목적과 관련된 사업

간행물

  • 간행물명
    통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) [Journal of Integrative Natural Science]
  • 간기
    계간
  • pISSN
    2005-1042
  • 수록기간
    2008~2026
  • 등재여부
    KCI 등재
  • 십진분류
    KDC 405 DDC 505

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