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작약(芍藥) 유전자 감별을 위한 psbA-trnH 부위 염기서열 분석 및 Marker Nucleotide 발굴
Identification of Marker Nucleotides for the Molecular Authentication of Paeoniae Radix Based on the Analysis of psbA-trnH Sequences

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  • 발행기관
    한약정보연구회 바로가기
  • 간행물
    한약정보연구회지 바로가기
  • 통권
    제3권 제2호 (2015.09)바로가기
  • 페이지
    pp.73-80
  • 저자
    김욱진, 지윤의, 문병철
  • 언어
    한국어(KOR)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A253807

원문정보

초록

영어
Purpose : The original plant species of Paeoniae Radix is differentially described in the national pharmacopoeia of Korea, China and Japan. To develop the reliable method for the authentication of four Paeonia species, P. lactiflora, P. japonica, Paeonia veitchii and P. suffruticosa, we analyzed psbA-trnH DNA barcode region and identified species-specific marker nucleotides. Materials and Methods : Plant materials were collected from different geographic regions in Korea and China, and psbA-trnH DNA barcode region were amplified using psbA3-f and trnHf-05 primer set. The DNA sequences were analyzed and aligned using the Bio-Edit program. The multiple alignment of each samples were also analyzed with the Bio-Edit program in order to calculate the genetic distance among the samples using unweight pair group method with arithmetic averages (UPGMA) anlysis. Results : PCR amplification rate of 12 samples used in this study were 100% for psbA- trnH region. In comparison of psbA-trnH sequences among four Paeonia species, we identified 1, 2, 2, and 16 species specific nucleotides enough to distinguish each species, respectively. These species-specific sequences could provide useful genetic marker nucleotides to discriminate the precise species among the analyzed four Paeonia species. Conclusion : We analyzed psbA-trnH region to confirm the availability of molecular authentication for Paeoninae Radix on species levels using four Paeonia species. As a result, we amplified PCR products of psbA-trnH region from all of the 12 samples and obtained total 21 marker nucleotides enough to distinguish each four Paeonia species. These marker nucleotides are useful genetic tool for the standardization of Paeonae Radix.

목차

Abstract
 서론
 재료 및 방법
  1. 실험재료
  2. DNA 추출 및 정량
  3. psbA-trnH 부위 PCR 증폭
  4. 염기서열 분석
  5. Marker nuclotide 탐색 및 종간 유연관계 분석
 결과 및 고찰
 결론
 감사의 글
 참고문헌

키워드

Marker Nucleotide Molecular Authentication Paeonia species Paeoniae Radix psbA-trnH

저자

  • 김욱진 [ Kim Wookjin | 한국한의학연구원 K-herb연구단 ]
  • 지윤의 [ Ji Yunui | 한국한의학연구원 K-herb연구단 ]
  • 문병철 [ Moon Byeongcheol | 한국한의학연구원 K-herb연구단 ] Corresponding author

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한약정보연구회 [The Society of Korean Herbal Medicine Information]
  • 설립연도
    2013
  • 분야
    의약학>한의학
  • 소개
    한약(한약재 및 한약제제)과 관련된 정보를 연구하는 모임으로서 2013년에 발족하였으며, 문헌·도표·전산자료 등의 한약 관련 정보를 수집·생산하거나 취합·편집·요약·평가 등 재가공하여 공유하고 발표하는 것을 주된 사업으로 삼고 있습니다.

간행물

  • 간행물명
    한약정보연구회지 [Korean Herbal Medicine Informatics]
  • 간기
    반년간
  • pISSN
    2288-5161
  • eISSN
    2288-5293
  • 수록기간
    2013~2025
  • 십진분류
    KDC 519 DDC 610

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