Cattle breeds were classified previously into three different haplogroups (Y1 and/or Y2 in Bos taurus and Y3 in B. indicus) based on Y chromosome-specific polymorphisms. In particular, a rapid and unambiguous classification method was reported recently. However, a haplogroup classification of Korean native cattle breeds has not been reported. In this study, 196 animal samples from four Korean native cattle breeds (Hanwoo, Chikso, Heugu, and Jeju black cattle) and six exotic breeds were used to determine the Y chromosome-specific haplogroup classification. We amplified an 81 bp indel region within intron 26 of the USP9Y gene and performed electrophoresis to classify the Y1 and Y2 haplogroups. Moreover, enzyme digestion was carried out with the SspI restriction enzyme to classify the Y2 and Y3 haplogroups. Finally, sequence variation in each haplogroup was confirmed by DNA sequencing. All animals in the four Korean native cattle and two exotic breeds (Charolais and Simmental) belonged to the Y2 haplogroup. Three other exotic breeds (Holstein, Angus, and Hereford) belonged to Y1 haplogroup. Japanese black cattle were divided into both the Y1 and Y2 haplogroups. The Y3 haplogroup corresponding to B. indicus was not found in this study. In conclusion, Korean native cattle breeds originated from B. taurus without introduction from B. indicus. In addition, they showed the same paternal heredity pattern which belonged to only Y2 haplogroup. These results can be used to investigate the origin of Korean native cattle breeds.
목차
ABSTRACT1 I. 서론 II. 재료 및 방법 1. 공시재료 및 DNA 추출 2. 증폭, 제한효소 처리 및 전기영동 3. 염기서열 분석 III. 결과 1. Haplogroup 분류 방법 및 공시 시료 2. 품종별 haplogroup 분류 3. 염기변이 확인 및 신규변이 동정 IV. 고찰 V. 요약 사사 VI. REFERENCES
키워드
Korean cattle breedHaplogroupY chromosomeUSP9Y
저자
김재환 [ Jae-Hwan Kim | 농촌진흥청 국립축산과학원 ]
서상원 [ Sangwon Suh | 농촌진흥청 국립축산과학원 ]
최성복 [ Seong-Bok Choi | 농촌진흥청 국립축산과학원 ]
변미정 [ Mi-Jeong Byun | 농촌진흥청 국립축산과학원 ]
김영신 [ Young-Sin Kim | 농촌진흥청 국립축산과학원 ]
이창우 [ Chang Woo Lee | 강원도 축산기술연구센터 ]
정경섭 [ Kyoung-Sub Jung | 충북 축산위생연구소 ]
김은성 [ Eun Sung Kim | 전북 축산위생연구소 ]
배경훈 [ Kyoung Hun Bae | 제주 축산진흥원 ]
조창연 [ Chang-Yeon Cho | 농촌진흥청 국립축산과학원 ]
Corresponding author
강원대학교 동물생명과학연구소(구 강원대학교 동물자원공동연구소) [Institute of Animal Life Science Kangwon National University]
설립연도
1999
분야
농수해양>축산학
소개
1970년 3월에 설립된 본 연구소는 국내외 동물자원에 관한 기초 및 응용연구를 통하여 축산업 발전을 선도하고 산학협동 체제를 강화하여 지역사회 발전에 기여함은 물론 통일에 대비한 북한 동물자원에 관한 연구를 체계적으로 수행하기 위함을 근본 목적으로 하고 있다.
본 연구소는 다변화, 과학화된 동물자원 분야에서 이론과 실제를 결부하는 연구활동 뿐만 아니라 학술 및 산학협동 활동 등을 인정받아 1991년에 교육부로부터 법정 연구소로 지정되었으며 1996년에는 이공계 첨단기자재 지원대상 연구소, 한우특성화대학 연구소로 지정되었고 1999년에는 학술진흥재단 대학 부설 중점연구소로 지정되었다. 이러한 지원과 국내외 동물자원 분야의 과학적 정립 및 연구, 발전이라는 고유한 목적 하에서 현재 국제적으로 축산업분야 중 심각한 문제를 가지고 있는 전염성 질병 및 그 대책 마련 등의 연구를 통해 현장애로 및 문제점을 해결하고, 실용적 축산 분뇨처리 방법 개발 및 새로운 축산물 가공품 개발과 유전공학 기법을 이용한 새로운 동물의 작출, 유전적 능력이 우수한 개체의 생산과 육종, 새로운 사료자원의 개발 등의 분야에서 세계적으로 선도적인 연구를 수행하고 있으며 관련분야에서 인정받는 국제적인 연구소로 발전하기 위해 노력을 기울이고 있다.