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Comparison of Two Academic Software Packages For Protein Structure Prediction

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  • 발행기관
    보안공학연구지원센터(IJBSBT) 바로가기
  • 간행물
    International Journal of Bio-Science and Bio-Technology SCOPUS 바로가기
  • 통권
    Vol.6 No.3 (2014.06)바로가기
  • 페이지
    pp.49-54
  • 저자
    Bayumy.A.Youssef, Shaheera Rashwan, ElRashdy M. Redwan
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A229904

※ 원문제공기관과의 협약기간이 종료되어 열람이 제한될 수 있습니다.

원문정보

초록

영어
Protein structure prediction has matured over the past few years to the point that even fully automated methods can provide reasonably accurate three-dimensional models of protein structures. However, until now it has not been possible to develop programs able to perform as well as human experts, who are still capable of systematically producing better models than automated servers. In this paper, we review and compare two recently developed and publicly available software packages, LOMETS and I-TASSER, for predicting protein structure in comparison with the commercial software package (Hyper Chem Release 8.0). These two software packages share some common features and also have some fundamental difference. Based on our experience, I-TASSER is more accurate in predicting protein structure. In contrast, LOMETS shows less performance than I-TASSER.

목차

Abstract
 1. Introduction
 2. Background
 3. Software for Comparison
  3.1. First Academic Software Package: LOMETS
  3.2. Second Academic Software Package: I-TASSER
 4. Software Results of Comparison
  4.1. Data Used for Comparison
  4.2. Software Results and Performance Evaluation
 5. Conclusions and Discussion
 References

키워드

Protein structure prediction TM-score Amino-acid sequence

저자

  • Bayumy.A.Youssef [ Informatics Research Institute,City for Scientific Research and Technological Applications, Borg ElArab, Alexandria, Egypt ]
  • Shaheera Rashwan [ Informatics Research Institute,City for Scientific Research and Technological Applications, Borg ElArab, Alexandria, Egypt ]
  • ElRashdy M. Redwan [ Genetic Engineering and BiotechnologyResearch Institute, City for Scientific Research and Technological Applications, Borg ElArab, Alexandria, Egypt ]

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    보안공학연구지원센터(IJBSBT) [Science & Engineering Research Support Center, Republic of Korea(IJBSBT)]
  • 설립연도
    2006
  • 분야
    공학>컴퓨터학
  • 소개
    1. 보안공학에 대한 각종 조사 및 연구 2. 보안공학에 대한 응용기술 연구 및 발표 3. 보안공학에 관한 각종 학술 발표회 및 전시회 개최 4. 보안공학 기술의 상호 협조 및 정보교환 5. 보안공학에 관한 표준화 사업 및 규격의 제정 6. 보안공학에 관한 산학연 협동의 증진 7. 국제적 학술 교류 및 기술 협력 8. 보안공학에 관한 논문지 발간 9. 기타 본 회 목적 달성에 필요한 사업

간행물

  • 간행물명
    International Journal of Bio-Science and Bio-Technology
  • 간기
    격월간
  • pISSN
    2233-7849
  • 수록기간
    2009~2016
  • 등재여부
    SCOPUS
  • 십진분류
    KDC 505 DDC 605

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