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Grouping DNA sequences with similarity measure and application

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  • 발행기관
    한국융합학회 바로가기
  • 간행물
    한국융합학회논문지 바로가기
  • 통권
    제4권 제3호 (2013.09)바로가기
  • 페이지
    pp.35-41
  • 저자
    Sanghyuk Lee
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A222819

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원문정보

초록

영어
Grouping problem with similarities between DNA sequences are studied. The similaritymeasure and the distance measure showed the complementary characteristics. Distance measure can be obtained by complementing similarity measure, and vice versa. Similarity measure is derived and proved. Usefulness of the proposed similarity measure is applied to grouping problem of 25 cockroach DNA sequences. By calculation of DNA similarity, 25 cockroaches are clustered by four groups, and the results are compared with the previous neighbor-joining method.

목차

Abstract
 1. Introduction
 2. Preliminary
  2.1 Some definitions of fuzzy entropy
  2.2 Fuzzy entropy with distance measure
 3. Derivation of Similarity Measure
 4. Illustrative Example
 5. Conclusions
 참고문헌

키워드

DNA sequence similarity measure fuzzy entropy

저자

  • Sanghyuk Lee [ Dept. of Electrical and Electronic Engineering, Xian Jiaotong-Liverpool University ] 교신저자

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한국융합학회 [Korea Convergence Society]
  • 설립연도
    2011
  • 분야
    복합학>학제간연구
  • 소개
    본회는 융합학문 및 융합기술을 교류를 통한 학문기술의 확대․발전․보급 및 기술개발 전략에 과학적으로 접근하여 융합학문 및 기술을 더욱 활성화하고, 회원 상호간의 정보 교류를 도모함으로써 지역과 나라발전에 기여함을 목적으로 한다.

간행물

  • 간행물명
    한국융합학회논문지 [Journal of the Korea Convergence Society]
  • 간기
    월간
  • pISSN
    2233-4890
  • 수록기간
    2010~2022
  • 십진분류
    KDC 530 DDC 620

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