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Structural analysis for carbohydrate-protein interaction using SPR kinetic analysis

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  • 발행기관
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  • 간행물
    한국당과학회 학술대회 바로가기
  • 통권
    2013 한국당과학회 동계학술대회 (2013.02)바로가기
  • 페이지
    pp.45-45
  • 저자
    Jeong Hyun Seo, Chang Sup Kim, Hyung Joon Cha
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A212707

※ 원문제공기관과의 협약기간이 종료되어 열람이 제한될 수 있습니다.

원문정보

초록

영어
Surface plasmon resonance (SPR) can provide a kinetic information for an interaction and rapidly monitor any dynamic process, such as adsorption or degradation, without the need for any sample preparation. Herein, we used SPR system to analyze carbohydrate-protein interaction, especially, Vibriocholeratoxin-GM1pentasaccharide. The understanding of carbohydrate contribution in carbohydrate-protein interaction may provide meaningful information about carbohydrate-related biological system. Interaction between ctxA and ctxB is firstly investigated in this study since the binding is a prerequisite for virulence mechanism. Interaction kinetics between ctxB and GM1 pentasaccharide using the our proposed saccharide immobilization method were evaluated, and the results showed similar degree of kinetics to the previous reports, therefore our direct immobilization could make SPR analysis simply for carbohydrate-related researches. And the introduction of ctxA during the interaction showed higher affinity than that of ctxB-GM1 although KD constant was 10-times lower than ctxB-GM1 binding. Comparative analyses for GM1 analogues-ctxAB were conducted in order to evaluate kinetic values from structural differences. Although these results did not show significant difference, determination of the association constants for ctxAB revealed the following order: LST-b > GM3 > LST-a > asialo GM1 and dissociation constants for ctxAB showed following order: LST-b > asialo GM1 > LST-a > GM3. These results indicate that sialic acid thumb is sufficient for recognition, and the terminal glalactose and GalNAc finger are required to stabilize the ctxAB-ganglioside GM1 interaction. Collectively, direct immobilization of carbohydrate at SPR-based analytical system can evaluate structural contribution of carbohydrate moieties in carbohydrate-protein interaction as well as provide valuable information for understanding the interactions.

저자

  • Jeong Hyun Seo [ Department of Chemical Engineering, Pohang University of Science and Technology (POSTTECH), Pohang, 790-784, Korea ]
  • Chang Sup Kim [ Department of Chemical Engineering, Pohang University of Science and Technology (POSTTECH), Pohang, 790-784, Korea ]
  • Hyung Joon Cha [ Department of Chemical Engineering, Pohang University of Science and Technology (POSTTECH), Pohang, 790-784, Korea ]

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한국당과학회 [Korean Society for Glycoscience]
  • 설립연도
    2006
  • 분야
    의약학>약학
  • 소개
    본 학회는 화학, 생화학, 분자생물학, 미생물학, 식품공학, 의학, 약학, 유전공학 및 생물공학, 환경 및 기타 공업 등 전 분야의 탄수화물관련 이론과 기술을 연구 발전시키고 산학협동을 통해 이를 보급하여 국내 관련 산업의 발전 및 국민생활의 과학화에 기여하고자 하며, 이러한 목표와 비젼의 실현을 위해 회원들이 적극적인 참여와 활동을 전개하고자 한다.

간행물

  • 간행물명
    한국당과학회 학술대회
  • 간기
    연간
  • 수록기간
    2006~2022
  • 십진분류
    KDC 517 DDC 614

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