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포스터 발표 : 효소공학

Prediction of 3D-structure and active site of newly cloned exo-type alginate lyase from marine bacterium, Sphingomonas sp. strain MJ-3

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  • 발행기관
    한국생물공학회 바로가기
  • 간행물
    한국생물공학회 학술대회 바로가기
  • 통권
    2012 춘계학술대회 및 국제심포지움 (2012.04)바로가기
  • 페이지
    pp.172-172
  • 저자
    Su In LEE, Hee Sook KIM, Eun Yeol LEE
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A174417

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원문정보

초록

영어
A newly cloned alginate lyase from Sphingomonas sp. MJ-3 showed exo-type and edo-type alginate degrading activity. Homology-modelled structure of MJ-3 aginate lyase shared low relationship with reported crystal structures. When the multiple sequence and conserved domains were analyzed, interestingly, the cloned gene product was predicted to consist of AlgL (alginate lyase L)-like protein domain and heparinase-like protein domain. AlgL domain in N-terminal and heparinase domain in C-terminal were homology-modeled on 3AFL.pdb and 2FUQ.pdb as templates, respectively. The amino acid residues in proposed active site were mutated and characterized. Acknowledgement : This work was supported by New &Renewable Energy R&D program(20093020090020) and Korea Institute for Advancement in Technology (KIAT) through the Workforce Development Program in Strategic Technology under the Korea Ministry of Knowledge Economy(MKE).

키워드

Exolytic lyase Sphingomonas sp. MJ-3 heparinase-like protein alginate monosaccharides

저자

  • Su In LEE [ Department of Food Science and Biotechnology, Kyungsung University, Busan 608-736, Korea. ]
  • Hee Sook KIM [ Department of Food Science and Biotechnology, Kyungsung University, Busan 608-736, Korea. ]
  • Eun Yeol LEE [ Department of Chemical Engineering, Kyung Hee University, Gyeonggi-do 446-701, Korea. ]

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한국생물공학회 [The Korean Society for Biotechnology and Bioengineering]
  • 설립연도
    1984
  • 분야
    공학>생물공학
  • 소개
    이 법인은 생물 공학의 발전과 보급에 이바지하고, 회원 상호 간의 연구 협력과 친목을 도모함을 목적으로 한다 1. 생물공학 분야의 발전을 위한 연구 협력 2. 생물공학의 실용화를 촉진시키기 위한 산학 협동 3. 학술연구 발표회, 강연회, 연수회 등 학술활동의 개최 4. 국,영문 학술지,소식지,학술회의 Proceedings 및 학술도서의 발간 5. 생물공학 발전을 위한 정책 건의 6. 기타 국제 교류 등 본 학회의 목적 달성을 위한 제반 활동

간행물

  • 간행물명
    한국생물공학회 학술대회
  • 간기
    반년간
  • 수록기간
    1985~2013
  • 십진분류
    KDC 476 DDC 576

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