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최신연구동향 II, Chair : Tae Seok Seo (KAIST, Korea)

Predictive Design of mRNA Translation Initiation Region to Control Prokaryotic Translation Efficiency

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  • 발행기관
    한국생물공학회 바로가기
  • 간행물
    한국생물공학회 학술대회 바로가기
  • 통권
    2012 춘계학술대회 및 국제심포지움 (2012.04)바로가기
  • 페이지
    pp.131-131
  • 저자
    Sang Woo SEO, Jae-Seong YANG, Inhae KIM, Jina YANG, Byung Eun MIN, Sanguk KIM, Gyoo Yeol JUNG
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A174322

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원문정보

초록

영어
Precise prediction of prokaryotic translation efficiency can provide valuable information for optimizing bacterial host for the production of biochemical compounds or recombinant proteins. However, dynamic changes in mRNA folding throughout translation make it difficult to assess translation efficiency. Here, we systematically determined the universal folding regions that affect the efficiency of translation arising via two different initiation mechanisms in Escherichia coli. By assessing the exquisite regions for mRNA folding, we could construct a predictive design method, UTR Designer, and demonstrate that proper codon optimization around the 5’-proximal coding sequence is necessary to achieve a broad range of expression levels. Finally, we applied our method to control the threshold value of input signals switching on a genetic circuit. This should increase our understanding of the processes underlying gene expression and provide an efficient design principle for optimizing various biological systems, thereby facilitating future efforts in metabolic engineering and synthetic biology.

키워드

5'-untranslated region mRNA secondary structure synthetic biology translation efficiency

저자

  • Sang Woo SEO [ Department of Chemical Engineering, POSTECH. ]
  • Jae-Seong YANG [ School of Interdisciplinary Bioscience and Bioengineering, POSTECH. ]
  • Inhae KIM [ Division of Molecular and Life Science, POSTECH. ]
  • Jina YANG [ Department of Chemical Engineering, POSTECH. ]
  • Byung Eun MIN [ School of Interdisciplinary Bioscience and Bioengineering, POSTECH. ]
  • Sanguk KIM [ Division of Molecular and Life Science and Division of IT Convergence Engineering, POSTECH. ]
  • Gyoo Yeol JUNG [ Department of Chemical Engineering and School of Interdisciplinary Bioscience and Bioengineering, POSTECH. ]

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한국생물공학회 [The Korean Society for Biotechnology and Bioengineering]
  • 설립연도
    1984
  • 분야
    공학>생물공학
  • 소개
    이 법인은 생물 공학의 발전과 보급에 이바지하고, 회원 상호 간의 연구 협력과 친목을 도모함을 목적으로 한다 1. 생물공학 분야의 발전을 위한 연구 협력 2. 생물공학의 실용화를 촉진시키기 위한 산학 협동 3. 학술연구 발표회, 강연회, 연수회 등 학술활동의 개최 4. 국,영문 학술지,소식지,학술회의 Proceedings 및 학술도서의 발간 5. 생물공학 발전을 위한 정책 건의 6. 기타 국제 교류 등 본 학회의 목적 달성을 위한 제반 활동

간행물

  • 간행물명
    한국생물공학회 학술대회
  • 간기
    반년간
  • 수록기간
    1985~2013
  • 십진분류
    KDC 476 DDC 576

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