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InBit : An Integrated Bioinformatics Toolkit for Biologists

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  • 발행기관
    보안공학연구지원센터(IJBSBT) 바로가기
  • 간행물
    International Journal of Bio-Science and Bio-Technology SCOPUS 바로가기
  • 통권
    Vol.3 No.4 (2011.12)바로가기
  • 페이지
    pp.1-10
  • 저자
    Ranojit Sarker, Sanghamitra Bandyopadhyay, Ujjal Maulik
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A167002

※ 원문제공기관과의 협약기간이 종료되어 열람이 제한될 수 있습니다.

원문정보

초록

영어
Here we report on the development of an Integrated Bioinformatics Toolkit (InBit) that is application-based software, integrating various bioinformatics programs for general purpose biological data analysis like gene prediction, gene analysis, protein analysis, sequence alignment, etc. InBit will enable the biologists to use the various programs for their research purpose without being bothered with their various technical aspects. It will also help graduate students and those who are newly using bioinformatics tools. Though the individual software that is integrated in InBit are available on the web and are quite user-friendly, they often become difficult to use when the size of the data set becomes quite large. In these cases, it becomes necessary to use standalone versions of many of this software, but this requires some prior knowledge of UNIX operating system. InBit merges the standalone properties of the software in a user-friendly menu-driven environment. It is open-ended UNIX/LINUX based software that can be extended by the user if so desired. Its hardware requirements are also very basic, requiring a optimum of 1GB RAM for efficient performance.

목차

Abstract
 1. Introduction
 2. Features
  2.1. System Recommendation
  2.2. Tools
  2.3. Basic User Interface
 3. Functionalities
 4. Installation of Software
  4.1. Installation of PERL/Tk
  4.2. Installation of EMBOSS
  4.3. Installation of GLIMMER
  4.4. Installation of RASMOL
 5. Conclusion
 References

키워드

Bioinformatics tools Biosoftware Gene analysis toos protein analysis tools

저자

  • Ranojit Sarker [ Dept. of biotechnology, Institute of Technology and Marine Engineering ]
  • Sanghamitra Bandyopadhyay [ Machine Intelligence Unit, Indian Statistical Institute, Kolkata, India ]
  • Ujjal Maulik [ Dept. of Computer Science and Engineering, Jadavpur University, kolkata, India ]

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    보안공학연구지원센터(IJBSBT) [Science & Engineering Research Support Center, Republic of Korea(IJBSBT)]
  • 설립연도
    2006
  • 분야
    공학>컴퓨터학
  • 소개
    1. 보안공학에 대한 각종 조사 및 연구 2. 보안공학에 대한 응용기술 연구 및 발표 3. 보안공학에 관한 각종 학술 발표회 및 전시회 개최 4. 보안공학 기술의 상호 협조 및 정보교환 5. 보안공학에 관한 표준화 사업 및 규격의 제정 6. 보안공학에 관한 산학연 협동의 증진 7. 국제적 학술 교류 및 기술 협력 8. 보안공학에 관한 논문지 발간 9. 기타 본 회 목적 달성에 필요한 사업

간행물

  • 간행물명
    International Journal of Bio-Science and Bio-Technology
  • 간기
    격월간
  • pISSN
    2233-7849
  • 수록기간
    2009~2016
  • 등재여부
    SCOPUS
  • 십진분류
    KDC 505 DDC 605

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