Earticle

초록

영어

Sequence homology analysis in the substances in the phenomenon of life is to create database by sorting and indexing and to demonstrate the usefulness of informatics. In this paper, Markov models are used in GenScan program to convert the pattern of complex eukaryotic protein sequences. It becomes impossible to navigate the minimum distance, complexity increases exponentially as the exact calculation. It is used scorecard in amino acid substitutions between similar amino acid substitutions to have a differential effect score, and is applied the Markov models sophisticated concealment of the transition probability model. As providing superior method to translate sequences homologous sequences in analysis using blast p, Markov models. is secreted protein structure of sequence translations.

한국어

서열 상동성 분석은 생명현상에 관여하는 물질을 정렬, 색인하여 데이터베이스 하는 것으로, 생명정보학의 유용성을 입증하는 분야이다. 본 논문에서는 구조가 복잡한 진핵생물의 서열 패턴을 단백질 서열로 변환하기 위해 은닉마르코프모델을 이용하는 GenScan 프로그램을 이용한다. 서열상동성 분석 중 최소거리 탐색 문제는 문제의 크기가 커지면 계산량이 기하급수적으로 증가하여 정확한 계산이 불가능해진다. 따라서 유사한 아미노산간의 치환과 상이한 아미노산간의 치환 점수를 차등화한 점수표를 적용하고, 은닉마르코프모델 등을 적용해 정교한 전이 확률모델을 적용한다. 변환된 서열을 서열 상동성 분석을 위해 사용되는 blast p를 이용하여, 은닉 마르코프 모델을 도입함으로 인해 단백질 구조 서열로 변환하는 데에 있어서 우수한 기능을 제공함을 알 수 있다.

목차

요약
 Abstnlct
 I. Introduction
 II. Related research
  1. prokaryotes and eukaryotes
  2. Hidden Markov Model
 III. GenScan
 IV. Experiments and experimental results
  1. Experi ments
  2. Experimental results
 V. Results
 VI. Conclusion
 REFERENCES

키워드

저자

• 정용규 [ Yong-Gyu Jung | 종신회원，을지대학교 의료IT마케팅학과 ]
• 임이슬 [ I-Suel Lim | 정회원，을지대학교 의료산업학부 의료전산학전공 ]
• 차병헌 [ Byung-Heun Cha | 정회원，을지대학교 임상병리학과 ] 교신저자

참고문헌

발행기관

간행물

표지보기 관심저널 등록

• 간행물명

  한국인터넷방송통신학회 논문지 [The Journal of the Institute of Internet, Broadcasting and Communication]

• 간기

  격월간

• pISSN

  2289-0238

• eISSN

  2289-0246

• 수록기간

  2001~2025

• 십진분류

  KDC 326 DDC 380