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포스터 발표 : 효소공학

Statistical Analysis for the Role of Cavity Flexibility in Protein Thermostability

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  • 발행기관
    한국생물공학회 바로가기
  • 간행물
    한국생물공학회 학술대회 바로가기
  • 통권
    2011년도 한국생물공학회 춘계학술발표대회 (2011.04)바로가기
  • 페이지
    pp.177-177
  • 저자
    Jeong Chan JOO, Young Joo YEON, Hoe Suk LEE, Young Je YOO
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A144642

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원문정보

초록

영어
Previous experimental and simulated results reported that mutations of protein cavity could improve the thermal stability. Many comparative studies between thermophilic and mesophilic proteins have been conducted to understand which cavity properties were related to the protein thermostability. However, previous statistical studies compared simple one dimensional information of cavities, e.g., surface area, volume, number of cavity and did not identify important differences of cavity properties between thermophilic and mesophilic proteins responsible for protein thermostability. In this study, we attempted to investigate the role of cavity properties in protein thermostability using three dimensional information of cavity properties. Protein structures were classified into three areas, i.e., core, boundary, and surface and cavity properties were compared using this structure index. According to statistical results, cavity flexibility is closely related to protein thermostability. Thermophilic proteins had less cavities in boundary and surface areas and in particular, cavities of mesophilic proteins in all areas were more flexible than those of thermophilic proteins. Compared to the thermophilic proteins, the flexible cavities of mesophilic proteins in boundary and surface can be deleterious to the stability. Based on this study, rational or computational design of flexibility cavity in surface or boundary areas could be a good strategy to improve the thermostability of mesophilic proteins.

키워드

thermostability thermophilic protein mesophilic protein cavity flexibility

저자

  • Jeong Chan JOO [ School of Chemical and Biological Engineering, Seoul National University, Seoul, 151-744. ]
  • Young Joo YEON [ School of Chemical and Biological Engineering, Seoul National University, Seoul, 151-744. ]
  • Hoe Suk LEE [ School of Chemical and Biological Engineering, Seoul National University, Seoul, 151-744. ]
  • Young Je YOO [ School of Chemical and Biological Engineering, Seoul National University, Seoul, 151-744. ]

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한국생물공학회 [The Korean Society for Biotechnology and Bioengineering]
  • 설립연도
    1984
  • 분야
    공학>생물공학
  • 소개
    이 법인은 생물 공학의 발전과 보급에 이바지하고, 회원 상호 간의 연구 협력과 친목을 도모함을 목적으로 한다 1. 생물공학 분야의 발전을 위한 연구 협력 2. 생물공학의 실용화를 촉진시키기 위한 산학 협동 3. 학술연구 발표회, 강연회, 연수회 등 학술활동의 개최 4. 국,영문 학술지,소식지,학술회의 Proceedings 및 학술도서의 발간 5. 생물공학 발전을 위한 정책 건의 6. 기타 국제 교류 등 본 학회의 목적 달성을 위한 제반 활동

간행물

  • 간행물명
    한국생물공학회 학술대회
  • 간기
    반년간
  • 수록기간
    1985~2013
  • 십진분류
    KDC 476 DDC 576

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