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효소공학

Protein Engineering for Improvement of Alginate Lyase Activity of Streptomyces sp. ALG-5

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  • 발행기관
    한국생물공학회 바로가기
  • 간행물
    한국생물공학회 학술대회 바로가기
  • 통권
    2010 추계학술대회 및 국제심포지움 (2010.10)바로가기
  • 페이지
    pp.183-183
  • 저자
    Hee Sook KIM, Eun Yeol LEE
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A129341

※ 원문제공기관과의 협약기간이 종료되어 열람이 제한될 수 있습니다.

원문정보

초록

영어
Polyguluronate specific lyase (EC 4.2.2.11) from Streptomyces sp.
ALG-5 was cloned in pColdI vector and characterized previously. We named the polyG-specific lyase as ALG5 lyase. Alg5 was engineered to improve the alginate degrading activity based on comparative homology modeling. The homology modeling of ALG5 lyase was constructed by using the 3D crystal structure (1UAI.pdb) of alginate lyase 2 from Corynebacterium sp. Aly1 as a template. ALG5 lyase belongs to polysaccharide lyase family 7 which the fold of the structure is β-jolly sandwich. ALG5 lyase had 8 β-strands (SA1-SA8)at upper layer and 7 β-strands (SB1-SB7) at lower layer. Active sites were formed with Arg72 of SA3, Gln117 of SA5, His119 of SA5, Tyr188 of SA4 and Tyr194 of SA5. In the case of water soluble protein, protein surface was known to be composed with hydrophilic amino acid residues whereas protein core was composed with hydrophobic amino acid residues. Stability of mutants was calculated with ProSa2003.
Glu101 on SB4 was mutated to hydrophobic amino acid, Phe, Leu, Met, Ile and Val. When Glu101 was mutated to Leucine, the alginate degrading activity was increased about 5 fold than that of original ALG5 lyase.

키워드

Polyguluronate-specific lyase protein engineering homology modeling mutation

저자

  • Hee Sook KIM [ Dept. of Food Science and Biotechnology, Kyungsung University, Busan. ]
  • Eun Yeol LEE [ Dept. of Chemical Engineering, Kyung Hee University, 446-701. ]

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한국생물공학회 [The Korean Society for Biotechnology and Bioengineering]
  • 설립연도
    1984
  • 분야
    공학>생물공학
  • 소개
    이 법인은 생물 공학의 발전과 보급에 이바지하고, 회원 상호 간의 연구 협력과 친목을 도모함을 목적으로 한다 1. 생물공학 분야의 발전을 위한 연구 협력 2. 생물공학의 실용화를 촉진시키기 위한 산학 협동 3. 학술연구 발표회, 강연회, 연수회 등 학술활동의 개최 4. 국,영문 학술지,소식지,학술회의 Proceedings 및 학술도서의 발간 5. 생물공학 발전을 위한 정책 건의 6. 기타 국제 교류 등 본 학회의 목적 달성을 위한 제반 활동

간행물

  • 간행물명
    한국생물공학회 학술대회
  • 간기
    반년간
  • 수록기간
    1985~2013
  • 십진분류
    KDC 476 DDC 576

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