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돼지 냄새물질 결합 단백질(pOBP 및 pPBP)에 대한 Tetrahydrofuran-2-yl 유도체의 분자도킹과 결합 상호작용
Molecular Docking of Tetrahydrofuran-2-yl Analogues to Porcine Odorant Binding Proteins (pOBP & pPBP) and Binding Interactions

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  • 발행기관
    한국동물생명공학회(구 한국동물번식학회) 바로가기
  • 간행물
    Reproductive & developmental biology 바로가기
  • 통권
    Volume 34 No 1 (2010.03)바로가기
  • 페이지
    pp.7-13
  • 저자
    조윤기, 박창식, 성낙도
  • 언어
    한국어(KOR)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A118476

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원문정보

초록

영어
The binding affinity constants (p(Od)50) and molecular docking scores (DS) between porcine odorant binding proteins pOBP (1HQP) and pPBP (1GM6) as receptor and a series of tetrahydrofuran-2-yl (A & B) analogues as substrate, and their interactions were discussed quantitatively using three-dimensional quantitative structure-activity relationship (3D-QSAR) models. The statistical qualities of the optimized CoMFA models for pOBP were better than those of the CoMSIA models. The binding affinity constants and DS between substrate and receptor molecules were dependent upon steric and hydrophobic interaction. The DS constants of the substrates into the binding site of OBP (1HQP) were bigger than those of PBP (1GM6). The resulting contour maps produced by the optimized CoMFA model were used to identify the structural features relevant to the binding affinity in binding site of pOBP.

목차

ABSTRACT
 서론
 재료 및 방법
  결합 친화력상수와 분자도킹
  물리-화학 파라미터 계산
  3D-QSAR 모델의 유도
  부분최소 자승(PLS) 계산
 결과
  결합 친화력과 DS
  pOBP에 대한 QSAR 모델
  DS에 대한 QSAR 모델
 고찰
  결합 친화력상수와 QSAR 모델
  기질-수용체 등고도 분석
  도킹 스코어와 QSAR 모델
  결합 친화력상수와 QSAR 모델
  기질-수용체 상호작용
 인용문헌

키워드

Binding affinity constants Docking scores pOBP (1HQP) & pPBP (1GM6) 3D-QSAR analyses models

저자

  • 조윤기 [ Yun-Gi Cho | 충남대학교 농업생명과학대학 응용생물환경화학과 ]
  • 박창식 [ Chang-Sik Park | 충남대학교 형질전환복제돼지연구센터 ]
  • 성낙도 [ Nack-Do Sung | 충남대학교 농업생명과학대학 응용생물환경화학과 ] Corresponding author

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한국동물생명공학회(구 한국동물번식학회) [The Korean Society of Animal Reproduction and Biotechnology]
  • 설립연도
    1976
  • 분야
    농수해양>축산학
  • 소개
    동물번식생리학, 동물생명공학, 수의학, 인공수정 및 수정란이식을 이용한 동물개량에 관한 이론과 기술의 발전을 통해 학계, 연구계, 산업계 및 양축가 상호간의 협력을 도모함으로써 동물과학발전 및 사회일반의 이익에 기여 한다는 목적을 위해 노력해 나가겠습니다.

간행물

  • 간행물명
    Reproductive & developmental biology
  • 간기
    계간
  • pISSN
    1738-2432
  • eISSN
    2288-0151
  • 수록기간
    1977~2018
  • 십진분류
    KDC 527 DDC 636

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