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동물 및 식물세포공학
A 3-D method enhances in-depth analysis of complex proteomes such as mammalian cell and tissue extracts
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- 발행기관
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- 간행물
- 한국생물공학회 학술대회 바로가기
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- 통권
- 2009 추계학술대회 및 국제심포지움 (2009.11)바로가기
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- 페이지
- pp.227-227
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- 저자
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- 언어
- 영어(ENG)
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- URL
- https://www.earticle.net/Article/A115256
※ 원문제공기관과의 협약기간이 종료되어 열람이 제한될 수 있습니다.
원문정보
초록
- 영어
- Current methods for quantitatively comparing complex proteomes such as two-dimensional
gel electrophoresis (2-DE), fluorescent 2-D difference in gel electrophoresis (2-D DIGE), and
liquid chromatography (LC)-mass spectrometry (MS) have limited resolution and dynamic
ranges, and consequently can detect only a small portion of complex proteomes. Therefore,
sample prefractionation is critical for more comprehensive coverage of the proteome and
reliable detection of low abundant proteins. In this study, we report a 3-D DIGE method using
DIGE labeling combined with microscale solution isoelectric focusing (MicroSol-IEF)
fractionation and subsequent analysis on slightly overlapping narrow pH range 2-D gels. To
illustrate its utility, this 3-D DIGE method was applied to analysis of human melanoma cell
lines and mouse lung tissue extracts. This method has the advantage of much more extensive
proteome coverage with detection of proteins over a wider concentration range compared with
conventional 2-D DIGE alone. In addition, the use of fluorescent labeling prior to MicroSol-
IEF avoids any complications resulting from slight run-to-run variations during MicroSol-IEF
fractionations or the subsequent 2-D gel separations. Thus the combination of MicroSol-IEF
and 2-D DIGE into a 3-D DIGE strategy produces a powerful method for more comprehensive
and quantitative comparison of protein profiles of very complex proteomes.[This work was
supported by National Institutes of Health Grants CA93372 and CA92725, as well as
institutional grants to the Wistar Institute including an NCI Cancer Core Grant (CA10815),
and grants from the Pennsylvania Department of Health]
키워드
MicroSol-IEF 3-D DIGE Complex proteomes저자
간행물 정보
발행기관
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- 발행기관명
- 한국생물공학회 [The Korean Society for Biotechnology and Bioengineering]
- 설립연도
- 1984
- 분야
- 공학>생물공학
- 소개
- 이 법인은 생물 공학의 발전과 보급에 이바지하고, 회원 상호 간의 연구 협력과 친목을 도모함을 목적으로 한다 1. 생물공학 분야의 발전을 위한 연구 협력 2. 생물공학의 실용화를 촉진시키기 위한 산학 협동 3. 학술연구 발표회, 강연회, 연수회 등 학술활동의 개최 4. 국,영문 학술지,소식지,학술회의 Proceedings 및 학술도서의 발간 5. 생물공학 발전을 위한 정책 건의 6. 기타 국제 교류 등 본 학회의 목적 달성을 위한 제반 활동
간행물
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- 간행물명
- 한국생물공학회 학술대회
- 간기
- 반년간
- 수록기간
- 1985~2013
- 십진분류
- KDC 476 DDC 576
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