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Quantitative Correlation between mRNA Secondary Structure around the Region Downstream of the Initiation Codon and Translational Efficiency in Escherichia coli

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  • 발행기관
    한국생물공학회 바로가기
  • 간행물
    한국생물공학회 학술대회 바로가기
  • 통권
    2009 춘계학술대회 및 국제심포지움 (2009.04)바로가기
  • 페이지
    pp.111-111
  • 저자
    Sang Woo SEO, Jina YANG, Gyoo Yeol JUNG
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A104673

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원문정보

초록

영어
Translational efficiency in Escherichia coli is known to be strongly influenced by the secondary structure around the ribosome-binding site and the initiation codon in the translational-initiation region of the mRNA. Several quantitative studies have reported that translational efficiency is attributable to effects on ribosome accessibility predominantly caused by the secondary structure surrounding the ribosome-binding site. However, the influence of mRNA secondary structure around regions downstream of the initiation codon on translational efficiency after ribosome-binding step has not been quantitatively studied. Here, we quantitatively analyzed the relationship between secondary structure of mRNA surrounding the region downstream of the initiation codon, referred to as the downstream region (DR), and protein expression levels. Modified hairpin structures containing the initiation codon were constructed by site-directed mutagenesis, and their effects on expression were analyzed in vivo. The minimal folding free energy (dG) of a local hairpin structure was found to be linearly correlated with the relative expression level over a range of 0.3- to 1.2-fold that of the wild-type structure. These results demonstrate that expression can be quantitatively controlled by changing the stability of the secondary structure surrounding the DR.

키워드

secondary structure translation efficiency downstream region

저자

  • Sang Woo SEO [ Department of Chemical Engineering, Pohang University of Science and Technology, San 31, Hyoja-dong, Nam-gu, Pohang, Gyeongbuk, Korea, 790-784. ]
  • Jina YANG [ Department of Chemical Engineering, Pohang University of Science and Technology, San 31, Hyoja-dong, Nam-gu, Pohang, Gyeongbuk, Korea, 790-784 ]
  • Gyoo Yeol JUNG [ 1Department of Chemical Engineering and School of Interdisciplinary Bioscience and Bioengineering, Pohang University of Science and Technology, San 31, Hyoja-dong, Nam-gu, Pohang, Gyeongbuk, Korea, 790-784. ]

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    한국생물공학회 [The Korean Society for Biotechnology and Bioengineering]
  • 설립연도
    1984
  • 분야
    공학>생물공학
  • 소개
    이 법인은 생물 공학의 발전과 보급에 이바지하고, 회원 상호 간의 연구 협력과 친목을 도모함을 목적으로 한다 1. 생물공학 분야의 발전을 위한 연구 협력 2. 생물공학의 실용화를 촉진시키기 위한 산학 협동 3. 학술연구 발표회, 강연회, 연수회 등 학술활동의 개최 4. 국,영문 학술지,소식지,학술회의 Proceedings 및 학술도서의 발간 5. 생물공학 발전을 위한 정책 건의 6. 기타 국제 교류 등 본 학회의 목적 달성을 위한 제반 활동

간행물

  • 간행물명
    한국생물공학회 학술대회
  • 간기
    반년간
  • 수록기간
    1985~2013
  • 십진분류
    KDC 476 DDC 576

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