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초록

영어

The X-ray structure of the cyclodextrin-glucanotransferase of Bacillus macerans was solved by molecular replacement at 2.0 Å resolution. The refined structure has a crystallographic R-factor of 16.6% (Rfree = 20.5%). A new metal binding site occupied by two Ca2+-ions was found at an accession channel of the active site. There is a large accumulation of negative charges that bind these Ca2+-ions, thereby connecting segment β13-αG (residue 254-276) to the main body of domain A (at αH, residue 283-297). The segment β13-αG contains the catalytic residue Glu258 between subsite 1 and -1 and Tyr260(subsite 2) which is located at the entrance of the active site. The Ca2+-site 3a,b may have a major role for the activity and specificity of this CGTase, although it is not even conserved for the α-subclass of CGTases.

한국어

2 Å의 분해능을 가진 Bacillus macerans에서 분리 정제한 cyclodextrin glucanotransferase의 결정 구조를 X-ray를 이용하여 분자 대치법을 사용하여 밝혔다. 정확한 구조는 16.6%(Rfree = 20.5%)의 결정학적 R-factor를 가지고 있다. 두개의 Ca2+-이온이 점유된 새로운 금속 결합자리는 활성 자리의 도달 채널에서 발견되었다. Ca2+-이온에 결합하는 음의 하전을 띤 아미노산 잔기들이 많이 밀집되어 있고 이 때, domain A(αH에서 아미노산 잔기 283-297)의 중심부에 연결 부분은 β13-αG 이었다. β13-αG 부분은 활성 자리의 입구에 위치한 subsite 1에서 -1 과 Tyr260 (subsite 2)사이에 있는 촉매 부위 Glu258을 포함하고 있다. 비록 α-CGTase 부류에서 잘 보존되어 있지는 않으나, 새로운 Ca2+-자리 3a,b가 이 α-CGTase의 활성도와 생성물의 특이성에 중요한 역할을 하리라 추측된다.

목차

Abstract
 서론
 재료 및 방법
  효소의 정제,활성도 측정 및 결정화
  Ca2+-이온의 제거
  X-ray 자료 수집
  분자 대체 모델 조립과 구조의 세밀화
 결과 및 고찰
 요약
 Abbreviations
 REFERENCES

키워드

저자

• 최희욱 [ Hui-Woog Choe | 전북대학교 자연과학대학 과학기술학부 화학과 ] Corresponding author
• 홍순강 [ Soon Kang Hong | 초당대학교 공과대학 환경공학과 ]

참고문헌

발행기관

간행물

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• 간행물명

  KSBB Journal

• 간기

  격월간

• pISSN

  1225-7117

• 수록기간

  2009~2013

• 십진분류

  KDC 476 DDC 576