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표고버섯의 EST 분석 및 DEG 분석에 의한 균사체와 자실체 발현 비교

원문정보

초록

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표고 버섯 자실체와 균사체의 EST 분석으로 Unigene 1,582개를 선별 하였으며 Expected-value를 고려한 유 효유전자를 10개 선별하였다. BAD11817.1, BAD11816.1, BAD11818.1, BAA28693.1 은 100% 의 상동성을 나타 내었으며, BAD97446.1, BAA83550.1, AAD37722.1에 서 90% 이상의 상동성을 나타내는 것으로 분석되었다. 표 고버섯 자실체 발생 관련 유전자를 분석하기 위해 기 발표 된 자실체 관련 발생 유전자 39개를 확인하였으며 GeneFishingTM DEG(Differentially Expressed Gene) screening 방법으로 300 bp ∼ 1,200 bp 범위에서 발현 반복 실험을 통해 재현성이 있고 밴드가 sharp한 90 개를 DEG 분석으로 선별하였다. 그 중에서 26개의 DEG 밴드 를 골라 염기서열을 결정하여 자실체에서 발현이 뚜렷하 게 보이는 유전자 6개를 확보하였다.

저자

  • 김명길 [ 국립산림과학원 임산공학부 화학미생물과 ]
  • 유선화 [ 국립산림과학원 임산공학부 화학미생물과 ]
  • 박원철 [ 국립산림과학원 임산공학부 화학미생물과 ]

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

    간행물 정보

    • 간행물
      한국버섯학회지 [Journal of MUSHROOMS]
    • 간기
      계간
    • pISSN
      1738-0294
    • eISSN
      2288-8853
    • 수록기간
      2003~2025
    • 등재여부
      KCI 등재
    • 십진분류
      KDC 525 DDC 635