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Molecular Docking Studies of Wolbachia Endosymbiont of Brugia Malayi’s Carbonic Anhydrase Using Coumarin-chromene Derivatives Towards Designing Anti-filarial Agents

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  • 발행기관
    조선대학교 기초과학연구원 바로가기
  • 간행물
    통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) KCI 등재 바로가기
  • 통권
    제9권 4호 (2016.12)바로가기
  • 페이지
    pp.268-274
  • 저자
    P. Malathy, G. Jagadeesan, K. Gunasekaran, S. Aravindhan
  • 언어
    영어(ENG)
  • URL
    https://www.earticle.net/Article/A291808

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원문정보

초록

영어
Filariasis causing nematode Brugia malayi is shown to harbor wolbachia bacteria as symbionts. The sequenced genome of the wolbachia endosymbiont from B.malayi (wBm) offers an unprecedented opportunity to identify new wolbachia drug targets. Hence the enzyme carbonic anhydrase from wolbachia endosymbiont of Brugia malayi (wBm) which is responsible for the reversible interconversion of carbon dioxide and water to bicarbonate and protons (or vice versa) is chosen as the drug target for filariasis. This enzyme is thought to play critical functions in bacteria by involving in various steps of their life cycle which are important for survival, The 3D structure of wBm carbonic anhydrase is predicted by selecting a suitable template using the similarity search tool, BLAST. The BLAST results shows a hexapeptide transferase family protein from Anaplasma phagocytophilum (PDB ID: 3IXC) having 77% similarity and 54% identity with wBm carbonic anhydrase. Hence the above enzyme is chosen as the template and the 3D structure of carbonic anhydrase is predicted by the tool Modeller9v7. Since the three dimensional structure of carbonic anhydrase from wolbachia endosymbiont of Brugia malayi has not yet solved, attempts were made to predict this protein. The predicted structure is validated and also molecular docking studies are carried out with the suitable inhibitors that have been solved experimentally.

목차

Abstract
 1. Introduction
 2. Material and Methods
  2.1. Sequence Analysis
  2.2. Homology Modeling
  2.3. Binding Site Analysis
  2.4. Docking
 3. Results and Discussion
  3.1. Sequence Analysis
  3.2. 3D Structure Prediction and Validation
  3.3 Active Site Prediction
  3.4 Docking Analysis
 4. Conclusion
 References

키워드

Carbonic Anhydrase Filariasis Wolbachia of Brugia Malayi (wBm) Induced Fit Docking Endosymbiotic.

저자

  • P. Malathy [ CAS in Crystallography and Biophysics, University of Madras, Chennai- 600025, India. ] Corresponding author
  • G. Jagadeesan [ Department of Physics, Presidency College, Chennai 600005, India ]
  • K. Gunasekaran [ CAS in Crystallography and Biophysics, University of Madras, Chennai- 600025, India. ]
  • S. Aravindhan [ Department of Physics, Presidency College, Chennai 600005, India ]

참고문헌

자료제공 : 네이버학술정보

간행물 정보

발행기관

  • 발행기관명
    조선대학교 기초과학연구원 [The Natural Science Research Institute of Chosun]
  • 설립연도
    2008
  • 분야
    자연과학>자연과학일반
  • 소개
    본 연구원은 기초과학을 진흥하기 위한 연구·교육 및 그 보급을 목적으로 한다. 이 목적을 달성하기 위하여 다음 각 호의 사업을 수행한다. 1. 기초과학 제 분야에 관한 조사와 연구 2. 기초과학에 관한 학술행사(학술대회, 학술세미나, 심포지엄, 초청강연회 등) 개최 3. 학문후속세대 및 일반인을 위한 기초과학 교육 4. 기관지『조선자연과학논문지』 발간 5. 『자연과학연구총서』, 『자연과학번역총서』 등 단행본 발간 6. 기타 본 연구원의 목적과 관련된 사업

간행물

  • 간행물명
    통합자연과학논문집(구 조선자연과학논문집) [Journal of Integrative Natural Science]
  • 간기
    계간
  • pISSN
    2005-1042
  • 수록기간
    2008~2025
  • 등재여부
    KCI 등재
  • 십진분류
    KDC 405 DDC 505

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